243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3937 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3937  LrgB family protein  100 
 
 		 238 aa  461  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3644  LrgB family protein  100 
 
 		 238 aa  461  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  95.38 
 
 		 238 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.337837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  71.85 
 
 		 238 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  72.27 
 
 		 238 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3388  LrgB family protein  70.89 
 
 		 238 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  64.26 
 
 		 240 aa  305  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  63.29 
 
 		 241 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0333  LrgB-like protein  66.09 
 
 		 240 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0492  LrgB-like protein  67.71 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0546  LrgB family protein  66.37 
 
 		 240 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  61.64 
 
 		 237 aa  258  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  60.87 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  56.72 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  59.48 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  53.62 
 
 		 239 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  55.07 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  55.07 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  54.42 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  55.07 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  54.39 
 
 		 239 aa  232  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  53.98 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  54.19 
 
 		 244 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  53.45 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  53.25 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  52.81 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  54.19 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  54.19 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  52.42 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  49.36 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  53.24 
 
 		 240 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  54.87 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  54.87 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  53.25 
 
 		 240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  47.41 
 
 		 245 aa  214  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  53.16 
 
 		 239 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  48.12 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  52.44 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  50 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  49.56 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3576  putative transmembrane protein  53.33 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  52.65 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0291  LrgB family protein  47.46 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  49.3 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  51.57 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4058  LrgB family protein  52.81 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1161  LrgB family protein  41.78 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1326  LrgB family protein  51.35 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.781498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0604  LrgB-like protein  48.92 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3332  putative transmembrane protein  52.81 
 
 		 238 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2558  LrgB family protein  50.88 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  48 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0424  LrgB family protein  50.24 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  43.36 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0431  LrgB-like protein  48.09 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.09203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0888  LrgB family protein  46.22 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  42.22 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2681  putative transmembrane protein, murein hydrolase LrgB like  40.79 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.888366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0713  LrgB family protein  36.21 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00614149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2299  LrgB family protein  45.5 
 
 		 195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0448  LrgB family protein  38.29 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  38.22 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  34.39 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  40.97 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  37.78 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  40.18 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  37.78 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  37.78 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  37.28 
 
 		 238 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3293  LrgB-like protein  37.26 
 
 		 237 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  37.78 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  35.48 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  37.99 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  40.11 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  38.67 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  35.98 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  36.15 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  36.15 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  36.15 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  35.94 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  36.15 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  36.44 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  37.31 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  36.15 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  32.65 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  36.15 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  36.15 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  35.94 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  35.48 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  35.65 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  35.65 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  35.65 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  35.65 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  38.22 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  36.68 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1010  LrgB family protein  32.89 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  35.65 
 
 		 231 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0747  LrgB family protein  41.4 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  36 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  38.64 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>