243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2795 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  100 
 
 		 241 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  90.04 
 
 		 241 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  78.75 
 
 		 240 aa  359  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  75.1 
 
 		 243 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  75.42 
 
 		 243 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  72.41 
 
 		 244 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  69.58 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  71.12 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  71.55 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  70.42 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  70.42 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  66.81 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  70.26 
 
 		 246 aa  299  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  66.23 
 
 		 239 aa  298  7e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  58.2 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  54.39 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  62.34 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  62.13 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  55.46 
 
 		 239 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  57.26 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  58.8 
 
 		 239 aa  254  9e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2558  LrgB family protein  62.71 
 
 		 243 aa  249  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  54.62 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  60.09 
 
 		 241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  58.01 
 
 		 239 aa  241  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  61.61 
 
 		 240 aa  241  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3576  putative transmembrane protein  56.84 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  57.96 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1161  LrgB family protein  51.75 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  56.64 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  55.13 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  53.07 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  52.79 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  53.54 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.337837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  50.88 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  56.89 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3388  LrgB family protein  55.51 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  53.3 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3937  LrgB family protein  54.42 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3644  LrgB family protein  54.42 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0888  LrgB family protein  57.14 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  54.09 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0424  LrgB family protein  60.77 
 
 		 240 aa  218  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  56.3 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  56.3 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0333  LrgB-like protein  51.98 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0291  LrgB family protein  49.78 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0604  LrgB-like protein  50.64 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0492  LrgB-like protein  52.49 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0546  LrgB family protein  52.25 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  51.72 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1326  LrgB family protein  49.77 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.781498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0431  LrgB-like protein  49.58 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.09203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  50 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4058  LrgB family protein  51.28 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  46.22 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  46.61 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2299  LrgB family protein  51.03 
 
 		 195 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  47.01 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3332  putative transmembrane protein  51.71 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  44.95 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  45.41 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  44.5 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  44.5 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  44.5 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0713  LrgB family protein  41.26 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00614149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  45.37 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  44 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  41.98 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  41.98 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  41.98 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  41.98 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  41.98 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  41.98 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  41.98 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  41.98 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  43.11 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  40.57 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0448  LrgB family protein  41.48 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  41.43 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  42.92 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  41.43 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  41.43 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  41.43 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  43.5 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  42.72 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  42.72 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  41.43 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  42.23 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  38.91 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  38.46 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2681  putative transmembrane protein, murein hydrolase LrgB like  45.05 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.888366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  40.43 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0747  LrgB family protein  50 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  40.29 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  37.02 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  39.34 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  36.94 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  37.56 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>