244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3064 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  100 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  65.71 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  58.2 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  58.61 
 
 		 241 aa  268  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  60.18 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  56.25 
 
 		 244 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  55 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  55 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  56.25 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  55.32 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  56.85 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  57.32 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  55.56 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  56.67 
 
 		 246 aa  244  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  56.25 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  56.25 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  56.03 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  54.74 
 
 		 238 aa  232  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.337837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  56.02 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  56.02 
 
 		 243 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  54.85 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  53.88 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  55.56 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  55.17 
 
 		 238 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3644  LrgB family protein  53.45 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3937  LrgB family protein  53.45 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  52.89 
 
 		 241 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  55.41 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2558  LrgB family protein  56.65 
 
 		 243 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  50.21 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  49.58 
 
 		 242 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  53.15 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3388  LrgB family protein  52.59 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  53.45 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  53.1 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  49.58 
 
 		 240 aa  211  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0291  LrgB family protein  50.87 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  52.89 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  52.23 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  51.56 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0888  LrgB family protein  53.5 
 
 		 243 aa  205  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3576  putative transmembrane protein  52.32 
 
 		 255 aa  204  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0333  LrgB-like protein  51.29 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  50.88 
 
 		 241 aa  201  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  50.44 
 
 		 241 aa  201  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0604  LrgB-like protein  48.29 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0492  LrgB-like protein  54.3 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1161  LrgB family protein  43.15 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0546  LrgB family protein  53.15 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415827  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1326  LrgB family protein  49.31 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.781498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  51.81 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0424  LrgB family protein  51.98 
 
 		 240 aa  181  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033887 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  45.06 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0431  LrgB-like protein  49.15 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.09203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  46.01 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  43.75 
 
 		 238 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  42.61 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4058  LrgB family protein  47.46 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  39.73 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  39.73 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  39.73 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  39.73 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  39.73 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  39.73 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  39.73 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  39.73 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  45.7 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  42.6 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  43.3 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  42.15 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  42.15 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  40.91 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  42.4 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  43.72 
 
 		 238 aa  158  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  39.46 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3332  putative transmembrane protein  47.88 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  41.7 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  41.1 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  39.82 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  38.36 
 
 		 231 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  42.13 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  42.63 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  38.64 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  38.64 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  40.4 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  38.64 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  40.4 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  38.64 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0713  LrgB family protein  36.94 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00614149  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  38.64 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  41.74 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0448  LrgB family protein  39.04 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  39.9 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  38.57 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2681  putative transmembrane protein, murein hydrolase LrgB like  40.89 
 
 		 240 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.888366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0373  LrgB-like protein  40.85 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2299  LrgB family protein  42.93 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  38.07 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  36.87 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  36.87 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>