244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4980 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  100 
 
 		 238 aa  463  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  87.76 
 
 		 238 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  87.76 
 
 		 238 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  87.34 
 
 		 238 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  86.92 
 
 		 238 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  79.41 
 
 		 238 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  80.67 
 
 		 238 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  75.54 
 
 		 236 aa  348  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  75.54 
 
 		 236 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  75.76 
 
 		 238 aa  339  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  69.62 
 
 		 238 aa  331  7.000000000000001e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  50.45 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  42.74 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  49.78 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  43.57 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  44 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  42.61 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  42.55 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  40.35 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  42.22 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  45.65 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  40.08 
 
 		 244 aa  158  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  40.44 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  41.33 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  39.64 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  40.44 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  40.44 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  43.56 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  38.67 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0713  LrgB family protein  40.91 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00614149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  40 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  41.55 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  40.72 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  41.63 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  41.1 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  43.39 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  40.44 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  40.44 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  39.74 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1161  LrgB family protein  38.84 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28740  putative effector of murein hydrolase  42.15 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4093  LrgB family protein  42.61 
 
 		 231 aa  144  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17883  normal  0.212309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  39.8 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0448  LrgB family protein  40.83 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  40.61 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2558  LrgB family protein  45.98 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  40.61 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  40.61 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  40.61 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  40.61 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  40.61 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  40.61 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  40.61 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  41.2 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2235  LrgB family protein  44.62 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  40.31 
 
 		 231 aa  141  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  39.29 
 
 		 231 aa  141  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  36.2 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  39.05 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  35.29 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  39.6 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  42.19 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  39.6 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0291  LrgB family protein  37.82 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  38.79 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  41.78 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  41.78 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  37.12 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  39.39 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  39.11 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  39.79 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1229  LrgB-like family protein  36.02 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  42.73 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3576  putative transmembrane protein  40.62 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  39.79 
 
 		 231 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  39.79 
 
 		 231 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  39.79 
 
 		 231 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  39.79 
 
 		 231 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0888  LrgB family protein  42.57 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  41.67 
 
 		 239 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  38.53 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  34.84 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  32.11 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  39.79 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1326  LrgB family protein  40 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.781498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3293  LrgB-like protein  39.13 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  38.07 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2543  hypothetical protein  40.4 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0604  LrgB-like protein  38.14 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  35.93 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  37.05 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  37.33 
 
 		 230 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  32.44 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1318  LrgB family protein  39.07 
 
 		 229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95009e-21 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  36.84 
 
 		 238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.337837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  33.19 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  36.48 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0212  LrgB family protein  40.27 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  35.43 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  35.43 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>