244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2448 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  455  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  78.35 
 
 		 231 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  77.06 
 
 		 232 aa  363  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  76.19 
 
 		 231 aa  360  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  74.46 
 
 		 231 aa  355  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  74.46 
 
 		 231 aa  355  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  76.65 
 
 		 231 aa  354  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  76.65 
 
 		 231 aa  354  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  76.65 
 
 		 231 aa  354  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  76.65 
 
 		 231 aa  354  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  74.03 
 
 		 231 aa  354  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  76.65 
 
 		 231 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2543  hypothetical protein  82.68 
 
 		 231 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  74.03 
 
 		 231 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  74.03 
 
 		 231 aa  349  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  74.03 
 
 		 231 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  74.03 
 
 		 231 aa  349  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  74.03 
 
 		 231 aa  349  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  74.03 
 
 		 231 aa  349  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  74.03 
 
 		 231 aa  349  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  73.59 
 
 		 231 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  74.78 
 
 		 231 aa  327  7e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  75 
 
 		 231 aa  322  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2765  hypothetical protein  77.17 
 
 		 231 aa  311  4.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  51.17 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02117  murein hydrolase export regulator  48.64 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003698  lrgA-associated membrane protein LrgB  48.2 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  41.89 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  41.63 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  41.44 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  41.44 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  42.57 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  43.44 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  43.44 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  41.1 
 
 		 245 aa  157  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  43.23 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  41.74 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1067  LrgB family protein  40.18 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  40.09 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  41.33 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  40.09 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  38.6 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  39.9 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  40.29 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1229  LrgB-like family protein  38.38 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  38.81 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0159  LrgB family protein  38.81 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  41.75 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  36.55 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  42.19 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  37.67 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2558  LrgB family protein  45.86 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  40.31 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  41.54 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  42.33 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  36.77 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0291  LrgB family protein  39.8 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  39.37 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  36.36 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  37.33 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  41.98 
 
 		 241 aa  138  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  40.19 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  34.6 
 
 		 231 aa  138  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  37.5 
 
 		 233 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  33.77 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  37.7 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  33.95 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  38.42 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  37.7 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  38.22 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  33.95 
 
 		 235 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0604  LrgB-like protein  38.94 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  37.7 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  35.78 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  36.65 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0811  putative effector of murein hydrolase  35.48 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00607912  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  34.12 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  37.44 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  34.12 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  38.54 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  41.15 
 
 		 241 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  35.65 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  38.71 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  44.13 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2563  hypothetical protein  32.89 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3576  putative transmembrane protein  40.28 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2616  hypothetical protein  32.89 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  38.62 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  33.33 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  36.51 
 
 		 238 aa  131  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  33.33 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  33.33 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  33.33 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  36.15 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  33.03 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  36.62 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  40.62 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  38.68 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>