242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0448 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0448  LrgB family protein  100 
 
 
240 aa  467  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0373  LrgB-like protein  65.9 
 
 
242 aa  256  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  45.02 
 
 
239 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  39.58 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  40.61 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  44.34 
 
 
239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  42.13 
 
 
239 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  41.48 
 
 
241 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  41.67 
 
 
248 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  44.29 
 
 
240 aa  158  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  42.13 
 
 
244 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  41.38 
 
 
238 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  43.24 
 
 
241 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  42.34 
 
 
244 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  43.44 
 
 
241 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  39.04 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  43.89 
 
 
246 aa  151  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  43.69 
 
 
244 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  40.51 
 
 
243 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  43.69 
 
 
244 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  41.13 
 
 
243 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  43.24 
 
 
244 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  42.27 
 
 
244 aa  149  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0713  LrgB family protein  38.46 
 
 
236 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00614149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  40.37 
 
 
238 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  41.48 
 
 
242 aa  148  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  41.28 
 
 
236 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  42.13 
 
 
238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3388  LrgB family protein  41.28 
 
 
238 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  41.67 
 
 
236 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  43.12 
 
 
238 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  40.37 
 
 
231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  40.37 
 
 
231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  40.37 
 
 
231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  40.37 
 
 
231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  40.37 
 
 
231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  40.37 
 
 
231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  40.37 
 
 
231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  42.27 
 
 
239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  43.69 
 
 
244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  43.69 
 
 
244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  39.91 
 
 
231 aa  144  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  40.83 
 
 
238 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0424  LrgB family protein  46.19 
 
 
240 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.033887 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  39.91 
 
 
231 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  40.18 
 
 
231 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  40.09 
 
 
239 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  40.18 
 
 
231 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  38.5 
 
 
241 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  40.18 
 
 
231 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  40.18 
 
 
231 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  37.5 
 
 
241 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2558  LrgB family protein  39.66 
 
 
243 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  39.45 
 
 
238 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  43.58 
 
 
238 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  40.18 
 
 
231 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  38.99 
 
 
238 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  40.09 
 
 
238 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  41.28 
 
 
238 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  38.99 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  40.18 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  38.99 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  44.07 
 
 
231 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3576  putative transmembrane protein  41.77 
 
 
255 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501932  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  39.63 
 
 
238 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  44.15 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  41.38 
 
 
241 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1161  LrgB family protein  35.37 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  38.53 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  38.53 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0291  LrgB family protein  36.13 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  43.11 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  38.07 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  36.94 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.337837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0492  LrgB-like protein  40.59 
 
 
241 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  37.61 
 
 
231 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3937  LrgB family protein  38.29 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3644  LrgB family protein  38.29 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  34.55 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  35.09 
 
 
239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4058  LrgB family protein  39.06 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  37.44 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0811  putative effector of murein hydrolase  35.84 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00607912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1326  LrgB family protein  37.33 
 
 
238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.781498 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0888  LrgB family protein  42.26 
 
 
243 aa  125  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0546  LrgB family protein  40.59 
 
 
240 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  36.7 
 
 
231 aa  125  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0604  LrgB-like protein  35.19 
 
 
241 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  37.61 
 
 
240 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  31.91 
 
 
231 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0333  LrgB-like protein  40.43 
 
 
240 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  36.99 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  32.97 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  36.57 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3332  putative transmembrane protein  39.06 
 
 
238 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  35.71 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  33.48 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  33.04 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4093  LrgB family protein  36.07 
 
 
231 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17883  normal  0.212309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  36.84 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>