242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6075 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  99.59 
 
 		 244 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  100 
 
 		 244 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  96.31 
 
 		 244 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  93.03 
 
 		 244 aa  441  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  94.67 
 
 		 244 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  94.67 
 
 		 244 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  85.66 
 
 		 246 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  71.12 
 
 		 241 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  67.92 
 
 		 241 aa  312  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  70.26 
 
 		 240 aa  291  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  65.49 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  64.71 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  67.24 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  67.24 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  61.86 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  55 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  51.46 
 
 		 245 aa  254  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  58.65 
 
 		 239 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  55.88 
 
 		 241 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  55.08 
 
 		 239 aa  248  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  58.67 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  58.08 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  59.48 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  62.16 
 
 		 240 aa  241  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  52.19 
 
 		 239 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  53.75 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  58.33 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2558  LrgB family protein  61.18 
 
 		 243 aa  235  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  55.36 
 
 		 238 aa  234  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  55.41 
 
 		 239 aa  231  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  53.3 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.337837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  52.56 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  54.74 
 
 		 238 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  53.3 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1161  LrgB family protein  50.66 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3388  LrgB family protein  55.6 
 
 		 238 aa  224  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3937  LrgB family protein  55.07 
 
 		 238 aa  224  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3644  LrgB family protein  55.07 
 
 		 238 aa  224  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3576  putative transmembrane protein  54.96 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  51.93 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  51.15 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  54.71 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0291  LrgB family protein  48.36 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0888  LrgB family protein  56.17 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  54.26 
 
 		 241 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0333  LrgB-like protein  49.57 
 
 		 240 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0424  LrgB family protein  55.34 
 
 		 240 aa  195  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1326  LrgB family protein  50.67 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.781498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0546  LrgB family protein  53.15 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0492  LrgB-like protein  52.7 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  48.28 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0604  LrgB-like protein  47.93 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0431  LrgB-like protein  51.06 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.09203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  51.79 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  45.21 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  44.75 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  44.75 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  44.75 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  44.75 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  44.75 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  44.75 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  44.75 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  44.75 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4058  LrgB family protein  51.54 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  44.09 
 
 		 231 aa  175  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  44.09 
 
 		 231 aa  175  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  43.64 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  43.11 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  47.95 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2681  putative transmembrane protein, murein hydrolase LrgB like  50 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.888366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  43.56 
 
 		 238 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  42.41 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  41.89 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  42.22 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  42.01 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  42.01 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  42.01 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  42.01 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  41.82 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  42.01 
 
 		 231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3332  putative transmembrane protein  51.98 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  40.27 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  39.82 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2299  LrgB family protein  49.74 
 
 		 195 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  39.38 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0713  LrgB family protein  41.3 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00614149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  41.28 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  41.28 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  41.28 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  41.28 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  43.38 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  42.66 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  38.74 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  42.58 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  40.44 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  43.98 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  43.1 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  42.2 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2543  hypothetical protein  43.89 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0747  LrgB family protein  46.15 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>