244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1096 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  98.73 
 
 		 236 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  76.69 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  76.69 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  76.27 
 
 		 238 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  75 
 
 		 238 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  79.31 
 
 		 238 aa  349  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  75.54 
 
 		 238 aa  347  9e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  72.65 
 
 		 238 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  73.08 
 
 		 238 aa  332  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  72.65 
 
 		 238 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  45.37 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  50.67 
 
 		 241 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  44.39 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  50.67 
 
 		 241 aa  168  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  45.62 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  42.79 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  42.13 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  43.93 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  43.98 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  40.37 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  42.41 
 
 		 244 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  44.6 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  41.44 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  44.04 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0713  LrgB family protein  39.91 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00614149  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  42.2 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  44.44 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  42.13 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  43.19 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  46.12 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  44.15 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  43.08 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  43.08 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  43.58 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  43.58 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  43.08 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  43.08 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  43.08 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  43.08 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  43.08 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  43.08 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  43.92 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  47.42 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  43.92 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  43.92 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  43.12 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  43.92 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  43.75 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  43.92 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  42.27 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  43.66 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  42.41 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  36.77 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  43.2 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  43.66 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  42.05 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0448  LrgB family protein  41.67 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  41.52 
 
 		 238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4093  LrgB family protein  44.5 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17883  normal  0.212309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  42.93 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  36.94 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  41.24 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  36.04 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2558  LrgB family protein  47.7 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0888  LrgB family protein  43.94 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  42.33 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28740  putative effector of murein hydrolase  40.95 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1161  LrgB family protein  37.85 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3576  putative transmembrane protein  43.98 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1229  LrgB-like family protein  34.12 
 
 		 240 aa  138  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  32.14 
 
 		 231 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  42.51 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0291  LrgB family protein  41.67 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  34.27 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  42.38 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  38.74 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  45.76 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  42.27 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  39.8 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  39.8 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  39.3 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  38.91 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  40.21 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1318  LrgB family protein  44.23 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95009e-21 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2765  hypothetical protein  40.09 
 
 		 231 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2235  LrgB family protein  40.71 
 
 		 247 aa  131  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0604  LrgB-like protein  43.61 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1326  LrgB family protein  42.31 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.781498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3293  LrgB-like protein  36.71 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  31.7 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0212  LrgB family protein  40.64 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  36.79 
 
 		 228 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  34.3 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  39.29 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  36.04 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  36.89 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  35.62 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1482  putative effector of murein hydrolase  36.57 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0187991  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  38.39 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>