243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3199 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  56.5 
 
 
236 aa  248  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  55.16 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  50.43 
 
 
231 aa  229  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  46.96 
 
 
234 aa  204  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1949  LrgB family protein  46.3 
 
 
236 aa  192  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  45.78 
 
 
232 aa  186  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  44.39 
 
 
239 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  46.26 
 
 
230 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  44.39 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5571  antiholin-like protein LrgB  42.73 
 
 
230 aa  175  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5293  antiholin-like protein LrgB  42.73 
 
 
230 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5120  antiholin-like protein LrgB  42.73 
 
 
230 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5135  antiholin-like protein LrgB  42.73 
 
 
230 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0238416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5563  antiholin-like protein LrgB  42.73 
 
 
230 aa  175  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5689  antiholin-like protein LrgB  42.73 
 
 
230 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5534  antiholin-like protein LrgB  42.73 
 
 
230 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5619  antiholin-like protein LrgB  42.73 
 
 
230 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5232  antiholin-like protein LrgB  42.73 
 
 
230 aa  175  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5386  antiholin-like protein LrgB  42.73 
 
 
230 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal  0.703231 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  42.47 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  38.72 
 
 
240 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  39.38 
 
 
244 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  38.84 
 
 
244 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  39.38 
 
 
244 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  39.48 
 
 
244 aa  169  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  40.37 
 
 
233 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  40.09 
 
 
239 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  38.77 
 
 
239 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  38.94 
 
 
244 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3956  antiholin-like protein LrgB  41.82 
 
 
230 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  41.1 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  37.05 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  38.12 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  38.84 
 
 
246 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1482  putative effector of murein hydrolase  39.09 
 
 
231 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0187991  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0159  LrgB family protein  42.34 
 
 
235 aa  159  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  37.02 
 
 
241 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  39.38 
 
 
244 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  39.38 
 
 
244 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  37.33 
 
 
225 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  36.24 
 
 
240 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  36.89 
 
 
236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  39.71 
 
 
239 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  39.45 
 
 
229 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  39.27 
 
 
243 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  39.27 
 
 
243 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  37.39 
 
 
236 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1161  LrgB family protein  37.22 
 
 
241 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  34.58 
 
 
230 aa  151  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  38.22 
 
 
231 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  38.22 
 
 
231 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  38.22 
 
 
231 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  38.22 
 
 
231 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  38.22 
 
 
231 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  38.22 
 
 
231 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  38.22 
 
 
231 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  35.19 
 
 
232 aa  150  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2027  antiholin-like protein LrgB  41.38 
 
 
233 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.69711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  37.96 
 
 
231 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  37.95 
 
 
238 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  38.81 
 
 
240 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  39.11 
 
 
231 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  39.52 
 
 
244 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  38 
 
 
230 aa  148  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0811  putative effector of murein hydrolase  37.78 
 
 
232 aa  148  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00607912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  35.78 
 
 
238 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  38.89 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  38.89 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  35.78 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  38.89 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  38.89 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  35.34 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  40.31 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  35.34 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  38.16 
 
 
241 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  38.69 
 
 
242 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  36.28 
 
 
238 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  38.66 
 
 
237 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  37.02 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  35.42 
 
 
238 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  38.67 
 
 
231 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  38.43 
 
 
231 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  36.54 
 
 
225 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  36.61 
 
 
235 aa  144  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0888  LrgB family protein  39.48 
 
 
243 aa  144  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  36.54 
 
 
225 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  36.54 
 
 
225 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  34.84 
 
 
238 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  36.54 
 
 
225 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  36.54 
 
 
225 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  36.54 
 
 
225 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  36.16 
 
 
235 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  36.54 
 
 
225 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  37.33 
 
 
231 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  37.95 
 
 
241 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  36.89 
 
 
231 aa  142  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  36.89 
 
 
231 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1010  LrgB family protein  35.84 
 
 
226 aa  142  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  36.06 
 
 
225 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>