243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3332 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3332  putative transmembrane protein  100 
 
 		 238 aa  447  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4058  LrgB family protein  99.58 
 
 		 238 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  60.85 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  63.03 
 
 		 238 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  54.31 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  52.81 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.337837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  56.83 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3388  LrgB family protein  55.79 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  52.94 
 
 		 239 aa  221  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  52.86 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  51.71 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  52.16 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  52.81 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  48.93 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  52.34 
 
 		 241 aa  218  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  51.56 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3644  LrgB family protein  52.81 
 
 		 238 aa  215  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3937  LrgB family protein  52.81 
 
 		 238 aa  215  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  51.71 
 
 		 241 aa  215  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  51.71 
 
 		 240 aa  215  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  53.19 
 
 		 244 aa  211  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  53.18 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  51.26 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0492  LrgB-like protein  54.67 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  47.06 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  47.21 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  43.1 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  52.42 
 
 		 244 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0333  LrgB-like protein  51.1 
 
 		 240 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  51.98 
 
 		 244 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0546  LrgB family protein  53.6 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415827  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  52.42 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  49.79 
 
 		 240 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  50.64 
 
 		 243 aa  197  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  52.34 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  50.64 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  47.88 
 
 		 245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  47.64 
 
 		 242 aa  195  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  53.3 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  53.3 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0291  LrgB family protein  48.1 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0888  LrgB family protein  50.85 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  47.47 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  49.78 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  47.81 
 
 		 244 aa  180  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0604  LrgB-like protein  47.46 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  50.23 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3576  putative transmembrane protein  48.55 
 
 		 255 aa  178  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  48.73 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1161  LrgB family protein  40.17 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1326  LrgB family protein  48.42 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.781498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  45.11 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0424  LrgB family protein  50.25 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2558  LrgB family protein  48.92 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  45 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  43.24 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0431  LrgB-like protein  46.06 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.09203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0448  LrgB family protein  40 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2681  putative transmembrane protein, murein hydrolase LrgB like  41.74 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.888366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  34.98 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0713  LrgB family protein  34.89 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00614149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  40.28 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2299  LrgB family protein  46.35 
 
 		 195 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  36.89 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  36.44 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  36.65 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  36.65 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  37.84 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  35 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  37.39 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  36.65 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  34.25 
 
 		 233 aa  128  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28740  putative effector of murein hydrolase  39.04 
 
 		 232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  37.44 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  35.71 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1318  LrgB family protein  40.28 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95009e-21 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  36 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  37.21 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  35.27 
 
 		 236 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  37.21 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  37.21 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  37.21 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  37.21 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  36.49 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  37.21 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  37.21 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  37.21 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  33.02 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4093  LrgB family protein  37.39 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17883  normal  0.212309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  32.74 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  36.36 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  36.2 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  36.99 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  36.99 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  36.53 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  36.74 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  36.74 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  31.67 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  36.25 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>