242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19690 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  96.05 
 
 
228 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4609  LrgB family protein  68.86 
 
 
228 aa  279  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242093  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0900  LrgB-like protein  67.11 
 
 
228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4625  LrgB family protein  69.16 
 
 
228 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669725  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  55.41 
 
 
231 aa  248  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4485  LrgB family protein  70.53 
 
 
223 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  56.56 
 
 
235 aa  244  6e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  53.88 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  56.11 
 
 
235 aa  241  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  55.61 
 
 
236 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  52.11 
 
 
235 aa  228  7e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  51.64 
 
 
235 aa  226  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3796  LrgB family protein  54.66 
 
 
240 aa  192  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  44.81 
 
 
224 aa  181  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0099  LrgB family protein  52.5 
 
 
224 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0082  LrgB-like protein  52.5 
 
 
224 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18459  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0089  LrgB family protein  52.5 
 
 
224 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  45.75 
 
 
241 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  44.91 
 
 
229 aa  175  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0273  LrgB family protein  44 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0268732  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4525  LrgB family protein  42.11 
 
 
229 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4532  lrgB-like family protein  42.11 
 
 
229 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.889737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4618  LrgB family protein  42.11 
 
 
229 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4616  LrgB family protein  42.11 
 
 
229 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4667  LrgB family protein  41.67 
 
 
229 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  40.47 
 
 
225 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0830  LrgB family protein  42.18 
 
 
229 aa  165  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2920  LrgB family protein  48.1 
 
 
240 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  38.05 
 
 
232 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  41.26 
 
 
225 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2767  hypothetical protein  45.33 
 
 
240 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0025  hypothetical protein  45.33 
 
 
240 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3499  hypothetical protein  45.33 
 
 
240 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1870  hypothetical protein  45.33 
 
 
240 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0026  LrgB-like family protein  45.33 
 
 
240 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2682  hypothetical protein  45.33 
 
 
240 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0027  LrgB-like family protein  45.33 
 
 
240 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0238  hypothetical protein  45.33 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  40.29 
 
 
225 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  40.29 
 
 
225 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  40.29 
 
 
225 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  40.29 
 
 
225 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  40.29 
 
 
225 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0245  LrgB family protein  43.56 
 
 
230 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  40.29 
 
 
225 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0061  LrgB family protein  45.02 
 
 
240 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775871  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0034  LrgB family protein  44.81 
 
 
240 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0043  LrgB family protein  44.81 
 
 
240 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  40.29 
 
 
225 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  40.29 
 
 
225 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0045  LrgB family protein  44.13 
 
 
240 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  39.81 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0028  LrgB-like protein  44.55 
 
 
240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0042  LrgB family protein  44.55 
 
 
240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3024  LrgB family protein  40.89 
 
 
239 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0892  LrgB family protein  42.22 
 
 
229 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3226  LrgB-like protein  44.08 
 
 
240 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.144978 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1686  hypothetical protein  43.48 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795605  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0976  LrgB family protein  41.82 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0955  LrgB family protein  41.82 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3388  LrgB family protein  41.82 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0990  LrgB family protein  41.82 
 
 
239 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3049  LrgB family protein  41.63 
 
 
244 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00126242  normal  0.0295055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0886  LrgB family protein  41.63 
 
 
244 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00106123  normal  0.143935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0923  LrgB family protein  41.63 
 
 
244 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.47828  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1048  hypothetical protein  41.63 
 
 
244 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  39.19 
 
 
244 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  38.74 
 
 
244 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  38.12 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  35.91 
 
 
230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  38.6 
 
 
240 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2926  hypothetical protein  43.06 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000884331  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  38.57 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  36.87 
 
 
230 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  36.87 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  36.87 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  36.87 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  36.87 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  36.87 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  32.42 
 
 
231 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  36.87 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  36.87 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  36.87 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6539  LrgB family protein  35.32 
 
 
226 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.198287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  36.45 
 
 
232 aa  135  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  38.12 
 
 
244 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  38.12 
 
 
244 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  37.32 
 
 
229 aa  134  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  33.18 
 
 
234 aa  134  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  38.39 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  35.68 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  35.71 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  39.01 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  36.16 
 
 
238 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  36.77 
 
 
239 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  36.89 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  37.56 
 
 
245 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  37.5 
 
 
241 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  33.66 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>