242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1161 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1161  LrgB family protein  100 
 
 		 241 aa  474  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0747  LrgB family protein  90.18 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  51.75 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  51.1 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  50.66 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  49.56 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  52.44 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  50.66 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  50.22 
 
 		 244 aa  225  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  51.75 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3576  putative transmembrane protein  52.17 
 
 		 255 aa  221  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  50.87 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  51.32 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  51.32 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  50.22 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  47.64 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  50.22 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  45.53 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  50.66 
 
 		 244 aa  207  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  47.39 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  45.33 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  44.44 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  43.78 
 
 		 245 aa  198  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  42.62 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  43.53 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  43.15 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  40.93 
 
 		 239 aa  194  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  42.67 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  41.59 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  45.37 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  43.36 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  43.95 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  42.36 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3388  LrgB family protein  43.97 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  40.25 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  40.89 
 
 		 238 aa  181  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.337837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0291  LrgB family protein  40.59 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  45.95 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0333  LrgB-like protein  41.15 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3937  LrgB family protein  41.78 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3644  LrgB family protein  41.78 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0546  LrgB family protein  41.89 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0604  LrgB-like protein  42.74 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2558  LrgB family protein  43.93 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1326  LrgB family protein  42.27 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.781498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0492  LrgB-like protein  42.08 
 
 		 241 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  42.29 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0431  LrgB-like protein  43.1 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.09203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  40.6 
 
 		 242 aa  164  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0424  LrgB family protein  47 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033887 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  37.83 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  42.79 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  42.79 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0888  LrgB family protein  44.61 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2681  putative transmembrane protein, murein hydrolase LrgB like  41.26 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.888366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  39.81 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  37.05 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  38.84 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  38.71 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  38.71 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0713  LrgB family protein  35.09 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00614149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  37 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  38.25 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  38.25 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  35.71 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4058  LrgB family protein  40.17 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  37.79 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  36.62 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  36.61 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  37.85 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  37.39 
 
 		 238 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  37.61 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  37.17 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3332  putative transmembrane protein  40.17 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0448  LrgB family protein  35.37 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28740  putative effector of murein hydrolase  35.71 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  32.73 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  32.73 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  32.73 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  34.01 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  32.73 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  32.43 
 
 		 231 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  32.73 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  34.65 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  34.65 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  36.19 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0373  LrgB-like protein  35.14 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  38.07 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  32.99 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  34.16 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  35.71 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2299  LrgB family protein  38.02 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02117  murein hydrolase export regulator  34.98 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4093  LrgB family protein  33.33 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17883  normal  0.212309 
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  34.65 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  32.31 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  34.65 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  31.47 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  32.31 
 
 		 231 aa  121  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>