243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1010 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1010  LrgB family protein  100 
 
 
226 aa  441  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  34.39 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  36.41 
 
 
239 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  36.04 
 
 
244 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  36.99 
 
 
233 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  35.29 
 
 
244 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  36.2 
 
 
244 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  36.2 
 
 
244 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  37.61 
 
 
244 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  35.29 
 
 
240 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  35.27 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  36 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  34.51 
 
 
236 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  34.26 
 
 
245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  34.51 
 
 
236 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  37.38 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  33.33 
 
 
245 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  35.38 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  32.87 
 
 
241 aa  138  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  33.48 
 
 
238 aa  138  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  34.68 
 
 
244 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  34.68 
 
 
244 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  35.86 
 
 
241 aa  138  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  33.33 
 
 
241 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  34.98 
 
 
244 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  33.5 
 
 
231 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  33.16 
 
 
232 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  31.67 
 
 
236 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  32.24 
 
 
239 aa  134  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  31.02 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  30.88 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  31.02 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  31.02 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  31.02 
 
 
238 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  31.8 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  33.68 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  33.68 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  33.68 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  31.05 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  30.49 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  33.16 
 
 
231 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  32.64 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  34.67 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  30.45 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  34.43 
 
 
231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  33.16 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  33.16 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  33.16 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  33.16 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  33.03 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1161  LrgB family protein  31.25 
 
 
241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  32.31 
 
 
231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  35.59 
 
 
239 aa  126  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  32.43 
 
 
230 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  29.73 
 
 
238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  31.79 
 
 
231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.640575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  31.79 
 
 
231 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  31.79 
 
 
231 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  31.79 
 
 
231 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  31.79 
 
 
231 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  31.79 
 
 
231 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  33.95 
 
 
241 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  31.79 
 
 
231 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  31.79 
 
 
231 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  34.7 
 
 
240 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0212  LrgB family protein  33.65 
 
 
237 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  32.44 
 
 
238 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.337837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  31.36 
 
 
239 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  34.42 
 
 
241 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  34.13 
 
 
239 aa  124  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  31.86 
 
 
230 aa  124  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  31.86 
 
 
230 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  31.86 
 
 
230 aa  124  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  31.86 
 
 
230 aa  124  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  31.86 
 
 
230 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  35 
 
 
243 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  35 
 
 
243 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  32.89 
 
 
238 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  32.42 
 
 
241 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1949  LrgB family protein  32.41 
 
 
236 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  31.86 
 
 
230 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  31.42 
 
 
230 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2558  LrgB family protein  38.95 
 
 
243 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  31.42 
 
 
230 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  32.29 
 
 
238 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  30.63 
 
 
238 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  31.03 
 
 
224 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  33.67 
 
 
242 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  31.42 
 
 
230 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  30.91 
 
 
240 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  31.94 
 
 
241 aa  121  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  30.95 
 
 
231 aa  121  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3937  LrgB family protein  32.89 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3644  LrgB family protein  32.89 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  30.77 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  32.6 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  34.98 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  33.33 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  32.73 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2765  hypothetical protein  30.88 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>