More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2190 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2190  iron-hydroxamate transporter permease subunit  100 
 
 
677 aa  1276    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.824441  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.02 
 
 
662 aa  398  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  40.03 
 
 
658 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.69 
 
 
639 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3331  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.42 
 
 
670 aa  346  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0996  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.42 
 
 
665 aa  346  8.999999999999999e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3460  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.42 
 
 
665 aa  346  8.999999999999999e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.63 
 
 
685 aa  343  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.63 
 
 
685 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.47 
 
 
685 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0212  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.16 
 
 
685 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.800681  normal  0.940729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0230  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.47 
 
 
685 aa  340  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.29 
 
 
655 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0693  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.84 
 
 
660 aa  334  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.24 
 
 
656 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0158  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.46 
 
 
660 aa  331  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1049  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.61 
 
 
669 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3449  transport system permease protein  40.31 
 
 
660 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307809  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3506  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.31 
 
 
660 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000390968  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00152  fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  40.15 
 
 
660 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000693779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  40.15 
 
 
660 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0165  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.5 
 
 
660 aa  328  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0145  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40 
 
 
660 aa  328  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.19 
 
 
660 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.59 
 
 
672 aa  327  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.39 
 
 
662 aa  327  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0157  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.69 
 
 
660 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1171  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.05 
 
 
672 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3579  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.93 
 
 
659 aa  325  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205233  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6721  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.84 
 
 
665 aa  319  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103992  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3107  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.64 
 
 
676 aa  316  8e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2783  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.54 
 
 
657 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.61 
 
 
671 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35 
 
 
694 aa  288  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.9 
 
 
664 aa  287  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  32.2 
 
 
655 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2778  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.67 
 
 
665 aa  268  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.39 
 
 
644 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1304  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.25 
 
 
670 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.56 
 
 
653 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0087  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.9 
 
 
658 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50350  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.5 
 
 
668 aa  253  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453628  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1438  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.81 
 
 
658 aa  250  7e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.08 
 
 
678 aa  247  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.54 
 
 
678 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.75 
 
 
678 aa  246  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.75 
 
 
678 aa  246  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.75 
 
 
678 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.75 
 
 
678 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.75 
 
 
678 aa  243  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3768  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.44 
 
 
658 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.35 
 
 
709 aa  216  9e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1141  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.42 
 
 
656 aa  201  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  33.39 
 
 
700 aa  191  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.66 
 
 
704 aa  187  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.92 
 
 
697 aa  180  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.34 
 
 
696 aa  178  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.92 
 
 
697 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.49 
 
 
696 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.23 
 
 
696 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.06 
 
 
704 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.37 
 
 
696 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.26 
 
 
702 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.41 
 
 
696 aa  163  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2463  transport system permease protein  33.73 
 
 
700 aa  160  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.43 
 
 
708 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.13 
 
 
706 aa  154  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.86 
 
 
706 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.28 
 
 
706 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.86 
 
 
706 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.86 
 
 
706 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.86 
 
 
706 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.86 
 
 
706 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2866  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.17 
 
 
678 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652395  hitchhiker  0.00619178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3054  transport system permease protein  33.74 
 
 
708 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0296  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.9 
 
 
677 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2124  transport system permease protein  39.01 
 
 
332 aa  131  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.105948  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  31.41 
 
 
332 aa  127  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  31.41 
 
 
332 aa  127  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  32.69 
 
 
333 aa  127  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  38.41 
 
 
315 aa  127  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.49 
 
 
659 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  36.71 
 
 
381 aa  124  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  35.77 
 
 
349 aa  124  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  36.65 
 
 
357 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  35.27 
 
 
352 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  34.78 
 
 
323 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  33.46 
 
 
315 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  36.56 
 
 
350 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  36.14 
 
 
346 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  33.45 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  33.22 
 
 
334 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  33.22 
 
 
334 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  36.52 
 
 
355 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  29.82 
 
 
337 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  34.14 
 
 
363 aa  118  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  31.14 
 
 
346 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  34.81 
 
 
330 aa  118  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  34.4 
 
 
340 aa  118  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  34.81 
 
 
318 aa  119  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>