More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2783 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2783  iron-hydroxamate transporter permease subunit  100 
 
 		 657 aa  1202    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.65 
 
 		 639 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3460  iron-hydroxamate transporter permease subunit  48.22 
 
 		 665 aa  452  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3331  iron-hydroxamate transporter permease subunit  48.22 
 
 		 670 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0996  iron-hydroxamate transporter permease subunit  48.22 
 
 		 665 aa  452  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  48.86 
 
 		 656 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  43.03 
 
 		 658 aa  445  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0693  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.72 
 
 		 660 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1171  iron-hydroxamate transporter permease subunit  48.16 
 
 		 672 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3579  iron-hydroxamate transporter permease subunit  51.04 
 
 		 659 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205233  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.83 
 
 		 662 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1049  iron-hydroxamate transporter permease subunit  52.58 
 
 		 669 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0230  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.34 
 
 		 685 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6721  iron-hydroxamate transporter permease subunit  47.06 
 
 		 665 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.34 
 
 		 685 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  48.72 
 
 		 662 aa  408  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.17 
 
 		 685 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3107  iron-hydroxamate transporter permease subunit  47.51 
 
 		 676 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.17 
 
 		 685 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0165  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.41 
 
 		 660 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0212  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.84 
 
 		 685 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.800681  normal  0.940729 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0145  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.48 
 
 		 660 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.64 
 
 		 660 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  48.43 
 
 		 655 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0158  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.48 
 
 		 660 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  48.87 
 
 		 672 aa  402  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3506  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.48 
 
 		 660 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000390968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0157  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.32 
 
 		 660 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00152  fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  46.32 
 
 		 660 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000693779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3449  transport system permease protein  46.32 
 
 		 660 aa  399  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307809  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  46.32 
 
 		 660 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.44 
 
 		 694 aa  342  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1304  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.8 
 
 		 670 aa  334  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0087  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.31 
 
 		 658 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1438  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.64 
 
 		 658 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2778  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.03 
 
 		 665 aa  317  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2190  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.13 
 
 		 677 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.824441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50350  iron-hydroxamate transporter permease subunit  52.38 
 
 		 668 aa  309  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453628  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.42 
 
 		 671 aa  297  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  34.87 
 
 		 655 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.04 
 
 		 664 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1141  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.75 
 
 		 656 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.64 
 
 		 653 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.39 
 
 		 644 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.92 
 
 		 678 aa  261  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.92 
 
 		 678 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.56 
 
 		 678 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.41 
 
 		 678 aa  253  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.41 
 
 		 678 aa  253  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.41 
 
 		 678 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3768  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.89 
 
 		 658 aa  250  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150372 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.46 
 
 		 678 aa  249  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.64 
 
 		 704 aa  236  8e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.08 
 
 		 709 aa  208  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  35.94 
 
 		 700 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.82 
 
 		 704 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.62 
 
 		 696 aa  193  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.46 
 
 		 696 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.08 
 
 		 696 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.67 
 
 		 697 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.08 
 
 		 696 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.69 
 
 		 659 aa  190  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.62 
 
 		 697 aa  190  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.98 
 
 		 696 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2463  transport system permease protein  37.85 
 
 		 700 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30490  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.83 
 
 		 708 aa  178  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0296  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.08 
 
 		 677 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.81 
 
 		 706 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.64 
 
 		 706 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.64 
 
 		 706 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.64 
 
 		 706 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.64 
 
 		 706 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.64 
 
 		 706 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3007  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.42 
 
 		 710 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000466246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2866  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.33 
 
 		 678 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652395  hitchhiker  0.00619178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3054  transport system permease protein  37.08 
 
 		 708 aa  154  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.44 
 
 		 706 aa  138  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.58 
 
 		 702 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  33.45 
 
 		 333 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.07 
 
 		 708 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0134  transport system permease protein  37.59 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  30.18 
 
 		 343 aa  127  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  32.97 
 
 		 367 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  33.33 
 
 		 322 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  33.57 
 
 		 326 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  33.33 
 
 		 322 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  33.11 
 
 		 336 aa  124  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  32.38 
 
 		 353 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 		 325 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  34.7 
 
 		 346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  34.7 
 
 		 346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  32.29 
 
 		 348 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  32.29 
 
 		 348 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  32.73 
 
 		 343 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  32.73 
 
 		 343 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  32.01 
 
 		 340 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  30.63 
 
 		 328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  32.47 
 
 		 315 aa  120  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  30.63 
 
 		 328 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  32.37 
 
 		 322 aa  120  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>