More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3107 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00152  fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  65.79 
 
 		 660 aa  727    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000693779  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3460  iron-hydroxamate transporter permease subunit  70.29 
 
 		 665 aa  810    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3449  transport system permease protein  65.94 
 
 		 660 aa  728    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307809  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  65.79 
 
 		 660 aa  727    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0212  iron-hydroxamate transporter permease subunit  66.51 
 
 		 685 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.800681  normal  0.940729 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0996  iron-hydroxamate transporter permease subunit  70.29 
 
 		 665 aa  810    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  66.82 
 
 		 685 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  66.82 
 
 		 685 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0230  iron-hydroxamate transporter permease subunit  66.82 
 
 		 685 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0158  iron-hydroxamate transporter permease subunit  65.79 
 
 		 660 aa  726    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0693  iron-hydroxamate transporter permease subunit  64.74 
 
 		 660 aa  749    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0145  iron-hydroxamate transporter permease subunit  65.48 
 
 		 660 aa  721    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  70.11 
 
 		 662 aa  749    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  68.95 
 
 		 672 aa  765    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3506  iron-hydroxamate transporter permease subunit  66.1 
 
 		 660 aa  728    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000390968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0157  iron-hydroxamate transporter permease subunit  66.67 
 
 		 660 aa  728    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1171  iron-hydroxamate transporter permease subunit  91.12 
 
 		 672 aa  1102    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3331  iron-hydroxamate transporter permease subunit  70.29 
 
 		 670 aa  811    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3107  iron-hydroxamate transporter permease subunit  100 
 
 		 676 aa  1286    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0165  iron-hydroxamate transporter permease subunit  66.35 
 
 		 660 aa  724    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  66.82 
 
 		 660 aa  727    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  66.98 
 
 		 685 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.56 
 
 		 639 aa  412  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.18 
 
 		 662 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  38.72 
 
 		 658 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1049  iron-hydroxamate transporter permease subunit  47.04 
 
 		 669 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3579  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.76 
 
 		 659 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205233  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.44 
 
 		 655 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2783  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.96 
 
 		 657 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6721  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.23 
 
 		 665 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.65 
 
 		 656 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.66 
 
 		 694 aa  334  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2778  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.92 
 
 		 665 aa  316  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1304  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.01 
 
 		 670 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  34.39 
 
 		 655 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.77 
 
 		 664 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.8 
 
 		 671 aa  310  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.25 
 
 		 678 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2190  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.52 
 
 		 677 aa  297  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.824441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50350  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.58 
 
 		 668 aa  296  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.54 
 
 		 678 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.59 
 
 		 678 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.1 
 
 		 678 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.1 
 
 		 678 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.95 
 
 		 678 aa  293  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.44 
 
 		 678 aa  292  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.76 
 
 		 653 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0087  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.49 
 
 		 658 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.5 
 
 		 704 aa  281  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1438  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.18 
 
 		 658 aa  280  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.28 
 
 		 644 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.8 
 
 		 709 aa  261  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1141  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.34 
 
 		 656 aa  258  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3768  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.8 
 
 		 658 aa  243  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  32.87 
 
 		 700 aa  221  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.62 
 
 		 704 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0296  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.57 
 
 		 677 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3007  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.74 
 
 		 710 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000466246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2463  transport system permease protein  33.28 
 
 		 700 aa  194  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.18 
 
 		 708 aa  194  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2866  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.08 
 
 		 678 aa  187  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652395  hitchhiker  0.00619178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.02 
 
 		 697 aa  187  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.15 
 
 		 702 aa  187  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.44 
 
 		 697 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30490  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  36.05 
 
 		 708 aa  185  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.12 
 
 		 696 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.12 
 
 		 696 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.8 
 
 		 696 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.01 
 
 		 696 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3054  transport system permease protein  34.52 
 
 		 708 aa  172  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.75 
 
 		 696 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.36 
 
 		 706 aa  165  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.28 
 
 		 706 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.78 
 
 		 706 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.78 
 
 		 706 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.78 
 
 		 706 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.78 
 
 		 706 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.78 
 
 		 706 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  37.42 
 
 		 350 aa  152  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  37.91 
 
 		 353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  33.86 
 
 		 319 aa  148  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  37.45 
 
 		 326 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 338 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 338 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 338 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  34.47 
 
 		 374 aa  139  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  35.22 
 
 		 352 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 		 340 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  33.33 
 
 		 338 aa  138  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 338 aa  138  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 338 aa  138  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 338 aa  138  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  34.06 
 
 		 340 aa  137  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  33.68 
 
 		 338 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  35.22 
 
 		 352 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  32.99 
 
 		 338 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  32.31 
 
 		 338 aa  137  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  35.22 
 
 		 352 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  35.22 
 
 		 352 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  32.31 
 
 		 338 aa  137  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>