More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2828 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  100 
 
 
644 aa  1237    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.71 
 
 
678 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.71 
 
 
678 aa  522  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.03 
 
 
678 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.87 
 
 
678 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.87 
 
 
678 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.39 
 
 
678 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.87 
 
 
678 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  42.33 
 
 
700 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.9 
 
 
709 aa  356  6.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.01 
 
 
704 aa  349  8e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.2 
 
 
662 aa  301  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30490  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.98 
 
 
708 aa  295  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161488  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3007  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.47 
 
 
710 aa  294  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000466246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.17 
 
 
685 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0212  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.3 
 
 
685 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.800681  normal  0.940729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.17 
 
 
685 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.69 
 
 
639 aa  290  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0296  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.36 
 
 
677 aa  290  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.17 
 
 
685 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00152  fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  36.36 
 
 
660 aa  290  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000693779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  36.36 
 
 
660 aa  290  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3506  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.36 
 
 
660 aa  290  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000390968  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0145  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.2 
 
 
660 aa  289  8e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0157  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.36 
 
 
660 aa  290  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0158  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.2 
 
 
660 aa  289  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0165  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.12 
 
 
660 aa  289  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.36 
 
 
660 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3449  transport system permease protein  36.36 
 
 
660 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307809  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0230  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.01 
 
 
685 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  33.93 
 
 
658 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3331  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.36 
 
 
670 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3460  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.36 
 
 
665 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.28 
 
 
697 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.76 
 
 
696 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0996  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.36 
 
 
665 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.12 
 
 
697 aa  278  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.18 
 
 
696 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.18 
 
 
696 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3054  transport system permease protein  38.87 
 
 
708 aa  272  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2463  transport system permease protein  38.75 
 
 
700 aa  272  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.33 
 
 
696 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0693  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.13 
 
 
660 aa  270  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1171  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.63 
 
 
672 aa  269  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.78 
 
 
708 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.26 
 
 
702 aa  266  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.16 
 
 
704 aa  266  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.71 
 
 
672 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.08 
 
 
696 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.13 
 
 
664 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.15 
 
 
694 aa  252  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.71 
 
 
659 aa  252  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3107  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.65 
 
 
676 aa  249  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6721  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.98 
 
 
665 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103992  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.72 
 
 
671 aa  247  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.53 
 
 
662 aa  245  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  30.87 
 
 
655 aa  243  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3579  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.79 
 
 
659 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205233  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  44.79 
 
 
319 aa  238  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  42.67 
 
 
326 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  46.95 
 
 
346 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  46.95 
 
 
346 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.86 
 
 
653 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.73 
 
 
655 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.28 
 
 
656 aa  233  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  44.3 
 
 
323 aa  233  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2866  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.81 
 
 
678 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652395  hitchhiker  0.00619178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  41.43 
 
 
353 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  45.45 
 
 
344 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  42.76 
 
 
352 aa  226  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 
352 aa  223  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  42.11 
 
 
352 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  42.11 
 
 
352 aa  223  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  42.11 
 
 
352 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  42.11 
 
 
352 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  41.78 
 
 
352 aa  223  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  41.78 
 
 
352 aa  223  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  41.78 
 
 
352 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.04 
 
 
706 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.04 
 
 
706 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.3 
 
 
706 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.04 
 
 
706 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.04 
 
 
706 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.04 
 
 
706 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  41.45 
 
 
352 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  42.55 
 
 
351 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1049  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.44 
 
 
669 aa  220  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.3 
 
 
706 aa  220  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  40.89 
 
 
323 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  51.1 
 
 
346 aa  216  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2190  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.09 
 
 
677 aa  214  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.824441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  40.82 
 
 
348 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  40.13 
 
 
350 aa  210  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  38.89 
 
 
350 aa  208  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2418  transport system permease protein  45.63 
 
 
335 aa  206  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2778  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.09 
 
 
665 aa  204  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 
338 aa  204  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  37 
 
 
321 aa  203  8e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  35.81 
 
 
345 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  36.6 
 
 
328 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>