More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1008 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  100 
 
 		 639 aa  1239    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  64.03 
 
 		 658 aa  777    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1049  iron-hydroxamate transporter permease subunit  51.59 
 
 		 669 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.46 
 
 		 662 aa  441  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3331  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.88 
 
 		 670 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3460  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.68 
 
 		 665 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0996  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.68 
 
 		 665 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1171  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.92 
 
 		 672 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0230  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.4 
 
 		 685 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3579  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.43 
 
 		 659 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205233  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.56 
 
 		 685 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.56 
 
 		 685 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0212  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.17 
 
 		 685 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.800681  normal  0.940729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.4 
 
 		 685 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.44 
 
 		 656 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.39 
 
 		 672 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.99 
 
 		 662 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2783  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.73 
 
 		 657 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0693  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.87 
 
 		 660 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0165  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.16 
 
 		 660 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00152  fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  41.17 
 
 		 660 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000693779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0158  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.16 
 
 		 660 aa  372  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3449  transport system permease protein  41.33 
 
 		 660 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3107  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.4 
 
 		 676 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  41.17 
 
 		 660 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0157  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.17 
 
 		 660 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.33 
 
 		 660 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3506  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.33 
 
 		 660 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000390968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.63 
 
 		 655 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6721  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.95 
 
 		 665 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0145  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.33 
 
 		 660 aa  365  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.77 
 
 		 694 aa  355  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50350  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.73 
 
 		 668 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453628  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.64 
 
 		 664 aa  339  9e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2190  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.69 
 
 		 677 aa  337  5.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.824441  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  34.22 
 
 		 655 aa  319  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.04 
 
 		 671 aa  313  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1304  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.1 
 
 		 670 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.51 
 
 		 678 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.25 
 
 		 678 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.09 
 
 		 678 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.3 
 
 		 678 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.3 
 
 		 678 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.3 
 
 		 678 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.15 
 
 		 678 aa  294  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2778  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.2 
 
 		 665 aa  293  9e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0087  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.95 
 
 		 658 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.69 
 
 		 653 aa  286  8e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1438  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.78 
 
 		 658 aa  286  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.69 
 
 		 644 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1141  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.22 
 
 		 656 aa  262  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.1 
 
 		 704 aa  256  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  33.17 
 
 		 700 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.03 
 
 		 709 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3768  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.71 
 
 		 658 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.12 
 
 		 702 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.74 
 
 		 708 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.24 
 
 		 704 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.97 
 
 		 697 aa  187  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.97 
 
 		 697 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.97 
 
 		 696 aa  185  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2866  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.55 
 
 		 678 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652395  hitchhiker  0.00619178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.97 
 
 		 696 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.97 
 
 		 696 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.27 
 
 		 696 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30490  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33.67 
 
 		 708 aa  179  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2463  transport system permease protein  31.2 
 
 		 700 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.74 
 
 		 659 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.66 
 
 		 696 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0296  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.74 
 
 		 677 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.58 
 
 		 706 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.53 
 
 		 706 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.58 
 
 		 706 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.58 
 
 		 706 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.58 
 
 		 706 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.58 
 
 		 706 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.1 
 
 		 706 aa  154  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3054  transport system permease protein  30.05 
 
 		 708 aa  151  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 338 aa  145  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 		 338 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 338 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  34.72 
 
 		 338 aa  144  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  34.72 
 
 		 338 aa  144  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  34.72 
 
 		 338 aa  144  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 338 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  34.72 
 
 		 338 aa  144  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 		 338 aa  144  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  34.27 
 
 		 322 aa  143  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  34.27 
 
 		 322 aa  143  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  34.31 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  35.34 
 
 		 350 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  33.33 
 
 		 338 aa  140  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  33.33 
 
 		 338 aa  140  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  34.27 
 
 		 338 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 		 321 aa  139  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  35.13 
 
 		 352 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  33.8 
 
 		 338 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 		 325 aa  138  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  34.81 
 
 		 352 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  34.81 
 
 		 352 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>