More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2866 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2866  iron-hydroxamate transporter permease subunit  100 
 
 		 678 aa  1259    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652395  hitchhiker  0.00619178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.03 
 
 		 697 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.72 
 
 		 708 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40 
 
 		 697 aa  310  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.08 
 
 		 696 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.44 
 
 		 696 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.44 
 
 		 696 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.22 
 
 		 704 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.81 
 
 		 696 aa  299  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.2 
 
 		 702 aa  299  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.09 
 
 		 696 aa  291  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.12 
 
 		 659 aa  290  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.55 
 
 		 644 aa  279  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.02 
 
 		 706 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.57 
 
 		 706 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.86 
 
 		 706 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.57 
 
 		 706 aa  273  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.57 
 
 		 706 aa  273  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.57 
 
 		 706 aa  273  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.57 
 
 		 706 aa  273  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.97 
 
 		 678 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.07 
 
 		 678 aa  264  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.13 
 
 		 678 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.81 
 
 		 678 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.97 
 
 		 678 aa  260  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.97 
 
 		 678 aa  260  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.97 
 
 		 678 aa  259  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.5 
 
 		 662 aa  253  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.3 
 
 		 704 aa  248  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.66 
 
 		 639 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0212  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.33 
 
 		 685 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.800681  normal  0.940729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.17 
 
 		 685 aa  234  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0230  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.17 
 
 		 685 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1171  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.07 
 
 		 672 aa  233  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3331  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.26 
 
 		 670 aa  232  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0996  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.26 
 
 		 665 aa  231  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3460  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.26 
 
 		 665 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.01 
 
 		 685 aa  231  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.85 
 
 		 685 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  36.54 
 
 		 700 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0693  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.23 
 
 		 660 aa  227  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00152  fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  32.82 
 
 		 660 aa  226  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000693779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3107  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.06 
 
 		 676 aa  226  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0157  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.82 
 
 		 660 aa  226  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  32.82 
 
 		 660 aa  226  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  32.26 
 
 		 658 aa  225  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3506  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.82 
 
 		 660 aa  225  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000390968  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3449  transport system permease protein  32.67 
 
 		 660 aa  224  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0165  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.51 
 
 		 660 aa  224  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.51 
 
 		 660 aa  224  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0158  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.46 
 
 		 660 aa  223  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0145  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.36 
 
 		 660 aa  223  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.5 
 
 		 662 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3579  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.81 
 
 		 659 aa  216  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205233  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.07 
 
 		 656 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.68 
 
 		 709 aa  214  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.08 
 
 		 664 aa  209  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2778  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.25 
 
 		 665 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.6 
 
 		 672 aa  205  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.1 
 
 		 655 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.96 
 
 		 653 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  28.85 
 
 		 655 aa  195  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  42.57 
 
 		 326 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.05 
 
 		 694 aa  187  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.74 
 
 		 671 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6721  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.92 
 
 		 665 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103992  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3712  transport system permease protein  41.26 
 
 		 318 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04154  iron-dicitrate transporter subunit  41.26 
 
 		 318 aa  173  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4865  iron-dicitrate transporter subunit FecD  41.26 
 
 		 318 aa  173  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0740  iron-dicitrate transporter subunit FecD  41.26 
 
 		 318 aa  173  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04117  hypothetical protein  41.26 
 
 		 318 aa  173  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3007  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.75 
 
 		 710 aa  171  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000466246 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  40.21 
 
 		 325 aa  168  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30490  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.63 
 
 		 708 aa  165  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  42.61 
 
 		 350 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  37.54 
 
 		 344 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4373  transport system permease protein  33.33 
 
 		 327 aa  160  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0296  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.44 
 
 		 677 aa  158  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  42.29 
 
 		 346 aa  158  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4440  iron compound ABC transporter permease  33.33 
 
 		 327 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4785  iron compound ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 327 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  35.76 
 
 		 325 aa  157  7e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4672  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 327 aa  157  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  37.64 
 
 		 332 aa  157  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  39.55 
 
 		 346 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  39.55 
 
 		 346 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 352 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4290  iron compound ABC transporter, permease  33.03 
 
 		 327 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4654  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 327 aa  156  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4279  iron compound ABC transporter, permease  33.03 
 
 		 327 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.551381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4659  iron compound ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 		 327 aa  156  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3768  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.86 
 
 		 658 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150372 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  38.01 
 
 		 353 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  36.86 
 
 		 319 aa  155  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0583  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 327 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1049  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.67 
 
 		 669 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.65 
 
 		 352 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  33.65 
 
 		 352 aa  154  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.65 
 
 		 352 aa  154  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  34.7 
 
 		 352 aa  154  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>