More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3579 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  61.37 
 
 		 656 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3579  iron-hydroxamate transporter permease subunit  100 
 
 		 659 aa  1226    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205233  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  54.81 
 
 		 655 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.43 
 
 		 639 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.87 
 
 		 685 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.71 
 
 		 685 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.87 
 
 		 685 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0212  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.54 
 
 		 685 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.800681  normal  0.940729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0230  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.87 
 
 		 685 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3460  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.8 
 
 		 665 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3331  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.8 
 
 		 670 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0996  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.8 
 
 		 665 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6721  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.16 
 
 		 665 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0693  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.09 
 
 		 660 aa  405  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.61 
 
 		 660 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00152  fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  43.16 
 
 		 660 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000693779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3449  transport system permease protein  43.16 
 
 		 660 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0165  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.45 
 
 		 660 aa  399  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  43.16 
 
 		 660 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.63 
 
 		 662 aa  399  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0145  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.16 
 
 		 660 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0157  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.1 
 
 		 660 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0158  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.16 
 
 		 660 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3506  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.32 
 
 		 660 aa  398  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000390968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.05 
 
 		 662 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  42.33 
 
 		 658 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2783  iron-hydroxamate transporter permease subunit  50.64 
 
 		 657 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1171  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.14 
 
 		 672 aa  389  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.41 
 
 		 672 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3107  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.01 
 
 		 676 aa  365  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1438  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.13 
 
 		 658 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0087  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.45 
 
 		 658 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2778  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.58 
 
 		 665 aa  334  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1049  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.1 
 
 		 669 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.7 
 
 		 671 aa  316  8e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.01 
 
 		 694 aa  310  5e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.58 
 
 		 664 aa  310  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1304  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.66 
 
 		 670 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  33.07 
 
 		 655 aa  298  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1141  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.29 
 
 		 656 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2190  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.76 
 
 		 677 aa  293  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.824441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50350  iron-hydroxamate transporter permease subunit  47 
 
 		 668 aa  290  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.93 
 
 		 653 aa  272  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.28 
 
 		 678 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.86 
 
 		 678 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.02 
 
 		 678 aa  267  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.02 
 
 		 678 aa  267  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.28 
 
 		 678 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.12 
 
 		 678 aa  266  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.07 
 
 		 678 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.54 
 
 		 644 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3768  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.46 
 
 		 658 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150372 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.39 
 
 		 704 aa  219  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.91 
 
 		 709 aa  219  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  34.87 
 
 		 700 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.6 
 
 		 697 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.76 
 
 		 697 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.47 
 
 		 696 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.47 
 
 		 696 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.28 
 
 		 704 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.21 
 
 		 696 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.32 
 
 		 696 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.11 
 
 		 696 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.87 
 
 		 702 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.2 
 
 		 659 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2866  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.7 
 
 		 678 aa  176  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652395  hitchhiker  0.00619178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3007  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.79 
 
 		 710 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000466246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2463  transport system permease protein  34.84 
 
 		 700 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.49 
 
 		 708 aa  170  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30490  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  36.65 
 
 		 708 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.47 
 
 		 706 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.08 
 
 		 706 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.08 
 
 		 706 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.47 
 
 		 706 aa  160  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.08 
 
 		 706 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.08 
 
 		 706 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.06 
 
 		 706 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0296  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.19 
 
 		 677 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3054  transport system permease protein  34.88 
 
 		 708 aa  146  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  36.64 
 
 		 353 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4123  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.4 
 
 		 645 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4271  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.4 
 
 		 645 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  37.63 
 
 		 350 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  37.68 
 
 		 318 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4922  iron compound ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 335 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1392  transport system permease protein  37.19 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  31.12 
 
 		 340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0329  transport system permease protein  36.49 
 
 		 335 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  35.51 
 
 		 352 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  35.34 
 
 		 326 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  37.5 
 
 		 342 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1395  iron compound ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 		 333 aa  127  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  36.97 
 
 		 330 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  35.51 
 
 		 352 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  35.14 
 
 		 352 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  35.14 
 
 		 352 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 352 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  35.14 
 
 		 352 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 352 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  39.58 
 
 		 357 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0133047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>