More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3768 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3768  iron-hydroxamate transporter permease subunit  100 
 
 		 658 aa  1191    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150372 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  51.13 
 
 		 671 aa  553  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.25 
 
 		 664 aa  529  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  44.65 
 
 		 655 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  53.15 
 
 		 653 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.99 
 
 		 662 aa  343  8e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.32 
 
 		 672 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0996  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.74 
 
 		 665 aa  298  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3460  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.74 
 
 		 665 aa  298  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0212  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.41 
 
 		 685 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.800681  normal  0.940729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3331  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.74 
 
 		 670 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.41 
 
 		 685 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.41 
 
 		 685 aa  294  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0230  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.25 
 
 		 685 aa  294  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  35.73 
 
 		 658 aa  293  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.25 
 
 		 685 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.61 
 
 		 694 aa  291  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.4 
 
 		 678 aa  291  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0693  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.03 
 
 		 660 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.56 
 
 		 678 aa  290  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3579  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.68 
 
 		 659 aa  289  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.3 
 
 		 678 aa  289  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0145  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39 
 
 		 660 aa  286  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1171  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.2 
 
 		 672 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.46 
 
 		 678 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.46 
 
 		 678 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.16 
 
 		 660 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.3 
 
 		 678 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.14 
 
 		 639 aa  283  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3506  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.16 
 
 		 660 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000390968  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3449  transport system permease protein  39 
 
 		 660 aa  282  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.39 
 
 		 662 aa  283  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0157  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.16 
 
 		 660 aa  282  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0158  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.25 
 
 		 660 aa  283  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00152  fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  39 
 
 		 660 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000693779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  39 
 
 		 660 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0165  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39 
 
 		 660 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.8 
 
 		 655 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.14 
 
 		 678 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3107  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.1 
 
 		 676 aa  261  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6721  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.99 
 
 		 665 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.18 
 
 		 656 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.37 
 
 		 644 aa  252  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2783  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.74 
 
 		 657 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2778  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.09 
 
 		 665 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2190  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.44 
 
 		 677 aa  240  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.824441  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1049  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.36 
 
 		 669 aa  225  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1304  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.36 
 
 		 670 aa  223  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.24 
 
 		 704 aa  221  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  34.31 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.07 
 
 		 697 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.55 
 
 		 697 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.89 
 
 		 696 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.69 
 
 		 696 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.18 
 
 		 696 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0087  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.39 
 
 		 658 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.57 
 
 		 696 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1438  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.39 
 
 		 658 aa  196  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.08 
 
 		 709 aa  196  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.33 
 
 		 696 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.5 
 
 		 708 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.3 
 
 		 704 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50350  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.65 
 
 		 668 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453628  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1141  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.28 
 
 		 656 aa  168  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.27 
 
 		 706 aa  164  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.26 
 
 		 706 aa  164  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.26 
 
 		 706 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.26 
 
 		 706 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.26 
 
 		 706 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.26 
 
 		 706 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.26 
 
 		 706 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2866  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.64 
 
 		 678 aa  156  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652395  hitchhiker  0.00619178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0296  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.6 
 
 		 677 aa  146  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2463  transport system permease protein  33.17 
 
 		 700 aa  144  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  34.53 
 
 		 323 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  40.28 
 
 		 381 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  39.21 
 
 		 343 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.7 
 
 		 702 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  34.91 
 
 		 340 aa  136  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  33.94 
 
 		 332 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3054  transport system permease protein  33.63 
 
 		 708 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  33.94 
 
 		 332 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  36.36 
 
 		 351 aa  135  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 352 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  30.45 
 
 		 337 aa  135  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 		 352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  35.09 
 
 		 352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  35.09 
 
 		 352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  35.09 
 
 		 352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.63 
 
 		 659 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  35.09 
 
 		 352 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  35.23 
 
 		 326 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 		 321 aa  134  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  36.08 
 
 		 349 aa  134  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  31.19 
 
 		 322 aa  134  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  31.19 
 
 		 322 aa  134  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 352 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  35.09 
 
 		 334 aa  133  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>