More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4801 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  100 
 
 		 655 aa  1219    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3579  iron-hydroxamate transporter permease subunit  54.81 
 
 		 659 aa  538  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205233  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  52.19 
 
 		 656 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0996  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.16 
 
 		 665 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3460  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.16 
 
 		 665 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.85 
 
 		 639 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3331  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.16 
 
 		 670 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0230  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.02 
 
 		 685 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0212  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.18 
 
 		 685 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.800681  normal  0.940729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.71 
 
 		 662 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.18 
 
 		 685 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.82 
 
 		 662 aa  382  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.93 
 
 		 685 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0693  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.55 
 
 		 660 aa  382  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6721  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.99 
 
 		 665 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.76 
 
 		 685 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1171  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.46 
 
 		 672 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  40.06 
 
 		 658 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0158  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.14 
 
 		 660 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00152  fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  41.82 
 
 		 660 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000693779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.98 
 
 		 660 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  41.82 
 
 		 660 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0145  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.82 
 
 		 660 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3506  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.98 
 
 		 660 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000390968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0165  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.14 
 
 		 660 aa  369  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0157  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.82 
 
 		 660 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3449  transport system permease protein  41.82 
 
 		 660 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307809  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2783  iron-hydroxamate transporter permease subunit  47.44 
 
 		 657 aa  360  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.29 
 
 		 672 aa  346  7e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3107  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.39 
 
 		 676 aa  345  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1304  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.71 
 
 		 670 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  35.54 
 
 		 655 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1049  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.87 
 
 		 669 aa  306  9.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.65 
 
 		 694 aa  302  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2778  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.95 
 
 		 665 aa  300  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.89 
 
 		 664 aa  297  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50350  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.99 
 
 		 668 aa  296  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453628  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1438  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.93 
 
 		 658 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2190  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.51 
 
 		 677 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.824441  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0087  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.45 
 
 		 658 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1141  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.45 
 
 		 656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.01 
 
 		 653 aa  274  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.07 
 
 		 671 aa  274  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.33 
 
 		 678 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.33 
 
 		 678 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.75 
 
 		 678 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.91 
 
 		 678 aa  266  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.33 
 
 		 678 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.75 
 
 		 678 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.17 
 
 		 678 aa  263  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.86 
 
 		 644 aa  243  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3768  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.81 
 
 		 658 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150372 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.99 
 
 		 704 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.76 
 
 		 709 aa  207  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.83 
 
 		 704 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.71 
 
 		 702 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.39 
 
 		 697 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.18 
 
 		 697 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  32.4 
 
 		 700 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.44 
 
 		 659 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2866  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.55 
 
 		 678 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652395  hitchhiker  0.00619178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.91 
 
 		 708 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.37 
 
 		 696 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.37 
 
 		 696 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.42 
 
 		 706 aa  174  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.42 
 
 		 706 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.42 
 
 		 706 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.42 
 
 		 706 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.42 
 
 		 706 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.32 
 
 		 706 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.32 
 
 		 706 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.1 
 
 		 696 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.57 
 
 		 696 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.34 
 
 		 696 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0296  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.7 
 
 		 677 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3007  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.67 
 
 		 710 aa  156  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000466246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2463  transport system permease protein  33.75 
 
 		 700 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30490  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33.54 
 
 		 708 aa  142  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3054  transport system permease protein  33.02 
 
 		 708 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4271  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.59 
 
 		 645 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192247  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4123  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.59 
 
 		 645 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 325 aa  128  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  35.41 
 
 		 326 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  37.84 
 
 		 334 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  37.84 
 
 		 334 aa  126  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  37.84 
 
 		 334 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  34.31 
 
 		 378 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  36.3 
 
 		 330 aa  124  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  29.47 
 
 		 376 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  33.79 
 
 		 338 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  33.79 
 
 		 338 aa  122  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  35.96 
 
 		 318 aa  122  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  33.79 
 
 		 338 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  33.79 
 
 		 338 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  33.79 
 
 		 338 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  39.37 
 
 		 334 aa  122  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0134  transport system permease protein  36.46 
 
 		 338 aa  120  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  32.73 
 
 		 343 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  32.73 
 
 		 343 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  33.79 
 
 		 338 aa  120  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>