More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_50350  iron-hydroxamate transporter permease subunit  100 
 
 		 668 aa  1208    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453628  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.12 
 
 		 639 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1049  iron-hydroxamate transporter permease subunit  55.9 
 
 		 669 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  43.4 
 
 		 658 aa  445  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1171  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.51 
 
 		 672 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3460  iron-hydroxamate transporter permease subunit  47.38 
 
 		 665 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3331  iron-hydroxamate transporter permease subunit  47.11 
 
 		 670 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0996  iron-hydroxamate transporter permease subunit  47.38 
 
 		 665 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0212  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.68 
 
 		 685 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.800681  normal  0.940729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.44 
 
 		 685 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0230  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.59 
 
 		 685 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.59 
 
 		 685 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0693  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.43 
 
 		 660 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.74 
 
 		 685 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.91 
 
 		 672 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3506  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.68 
 
 		 660 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000390968  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00152  fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  44.53 
 
 		 660 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000693779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3449  transport system permease protein  44.53 
 
 		 660 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  47.49 
 
 		 662 aa  409  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  44.53 
 
 		 660 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0165  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.88 
 
 		 660 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0157  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.38 
 
 		 660 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0158  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.5 
 
 		 660 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.07 
 
 		 660 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0145  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.38 
 
 		 660 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3107  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.67 
 
 		 676 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40 
 
 		 662 aa  399  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  47.73 
 
 		 655 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.5 
 
 		 656 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3579  iron-hydroxamate transporter permease subunit  47.17 
 
 		 659 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205233  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2783  iron-hydroxamate transporter permease subunit  50.93 
 
 		 657 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6721  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.02 
 
 		 665 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.51 
 
 		 694 aa  334  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.45 
 
 		 671 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1304  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.81 
 
 		 670 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2778  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.03 
 
 		 665 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2190  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.9 
 
 		 677 aa  317  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.824441  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0087  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.92 
 
 		 658 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1438  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.48 
 
 		 658 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.08 
 
 		 664 aa  283  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1141  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.95 
 
 		 656 aa  281  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.87 
 
 		 653 aa  279  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  32.32 
 
 		 655 aa  269  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.22 
 
 		 678 aa  259  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.22 
 
 		 678 aa  258  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.07 
 
 		 678 aa  257  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.91 
 
 		 678 aa  257  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.91 
 
 		 678 aa  257  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.91 
 
 		 678 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.91 
 
 		 678 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.33 
 
 		 644 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3768  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.97 
 
 		 658 aa  230  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.86 
 
 		 709 aa  216  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.76 
 
 		 704 aa  213  7e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  34.74 
 
 		 700 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.59 
 
 		 704 aa  179  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4271  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.91 
 
 		 645 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192247  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4123  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.91 
 
 		 645 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.59 
 
 		 697 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.59 
 
 		 697 aa  170  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.22 
 
 		 702 aa  164  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.85 
 
 		 659 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0296  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.72 
 
 		 677 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.38 
 
 		 696 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.38 
 
 		 696 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.84 
 
 		 696 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.91 
 
 		 708 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2463  transport system permease protein  35.76 
 
 		 700 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.92 
 
 		 706 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.92 
 
 		 706 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.92 
 
 		 706 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3007  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34 
 
 		 710 aa  147  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000466246 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.92 
 
 		 706 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.92 
 
 		 706 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.92 
 
 		 706 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.92 
 
 		 706 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  30.72 
 
 		 337 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  30.38 
 
 		 337 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04155  iron-dicitrate transporter subunit  39.07 
 
 		 332 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3711  transport system permease protein  39.07 
 
 		 332 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04118  hypothetical protein  39.07 
 
 		 332 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4866  iron-dicitrate transporter permease subunit  39.07 
 
 		 332 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0741  iron-dicitrate transporter permease subunit  39.07 
 
 		 332 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  37.99 
 
 		 353 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  33.9 
 
 		 333 aa  127  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3054  transport system permease protein  33.84 
 
 		 708 aa  127  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01764  ABC-type Fe3+-siderophore transporter  37.28 
 
 		 327 aa  127  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  35.1 
 
 		 350 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  30 
 
 		 337 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  33.57 
 
 		 350 aa  126  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7289  ABC transporter  38.75 
 
 		 327 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2124  transport system permease protein  38.46 
 
 		 332 aa  124  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.105948  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  34.63 
 
 		 323 aa  124  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  32.98 
 
 		 338 aa  124  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 		 343 aa  124  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  32.98 
 
 		 338 aa  124  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 		 338 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 		 338 aa  122  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  33.7 
 
 		 346 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>