More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1304 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1304  iron-hydroxamate transporter permease subunit  100 
 
 		 670 aa  1254    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0212  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.03 
 
 		 685 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.800681  normal  0.940729 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0996  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.01 
 
 		 665 aa  398  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3331  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.01 
 
 		 670 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3460  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.01 
 
 		 665 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.15 
 
 		 685 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0230  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.03 
 
 		 685 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.03 
 
 		 685 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0158  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.15 
 
 		 660 aa  392  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.62 
 
 		 660 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0165  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.62 
 
 		 660 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.88 
 
 		 685 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3506  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44 
 
 		 660 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000390968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0145  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.85 
 
 		 660 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00152  fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  43.85 
 
 		 660 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000693779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3449  transport system permease protein  43.85 
 
 		 660 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307809  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0157  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.69 
 
 		 660 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0693  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.07 
 
 		 660 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  43.85 
 
 		 660 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  40.32 
 
 		 658 aa  372  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.26 
 
 		 639 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1171  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.86 
 
 		 672 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.53 
 
 		 662 aa  365  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.63 
 
 		 672 aa  362  9e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.69 
 
 		 656 aa  359  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.71 
 
 		 655 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2783  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.07 
 
 		 657 aa  341  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3107  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.25 
 
 		 676 aa  339  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3579  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.53 
 
 		 659 aa  337  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1049  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.66 
 
 		 669 aa  319  7.999999999999999e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6721  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.88 
 
 		 665 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.54 
 
 		 662 aa  301  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.91 
 
 		 671 aa  293  8e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.9 
 
 		 694 aa  289  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2190  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.22 
 
 		 677 aa  288  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.824441  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2778  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.59 
 
 		 665 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.61 
 
 		 664 aa  269  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0087  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.97 
 
 		 658 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1438  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.81 
 
 		 658 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1141  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.54 
 
 		 656 aa  265  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  32.02 
 
 		 655 aa  259  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50350  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.32 
 
 		 668 aa  248  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.11 
 
 		 678 aa  242  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.22 
 
 		 653 aa  240  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.95 
 
 		 678 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.27 
 
 		 678 aa  239  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.79 
 
 		 678 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.59 
 
 		 678 aa  239  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.79 
 
 		 678 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.12 
 
 		 644 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.79 
 
 		 678 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3768  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.88 
 
 		 658 aa  213  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.12 
 
 		 704 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4271  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.6 
 
 		 645 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192247  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4123  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.6 
 
 		 645 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.12 
 
 		 704 aa  197  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.15 
 
 		 708 aa  194  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.14 
 
 		 697 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.46 
 
 		 697 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.78 
 
 		 702 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.39 
 
 		 696 aa  180  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.85 
 
 		 696 aa  180  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.85 
 
 		 696 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.59 
 
 		 696 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.94 
 
 		 659 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.74 
 
 		 696 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.71 
 
 		 706 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.86 
 
 		 706 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.86 
 
 		 706 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.71 
 
 		 706 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.71 
 
 		 706 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.71 
 
 		 706 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.71 
 
 		 706 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.62 
 
 		 709 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  33.63 
 
 		 700 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2866  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.88 
 
 		 678 aa  134  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652395  hitchhiker  0.00619178 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  34.04 
 
 		 362 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2463  transport system permease protein  34.5 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  31.65 
 
 		 333 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  31.64 
 
 		 351 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  33.45 
 
 		 326 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  36.64 
 
 		 354 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  35.56 
 
 		 358 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  30.99 
 
 		 343 aa  110  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  32.14 
 
 		 336 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  33.44 
 
 		 315 aa  109  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  35.81 
 
 		 381 aa  109  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3054  transport system permease protein  32.92 
 
 		 708 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  31.14 
 
 		 332 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  31.14 
 
 		 332 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  30.94 
 
 		 351 aa  107  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  32.62 
 
 		 353 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  33.33 
 
 		 340 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  35.47 
 
 		 358 aa  106  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  32.48 
 
 		 338 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  31.72 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  32.12 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  30 
 
 		 347 aa  106  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  31.06 
 
 		 319 aa  106  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>