More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2087 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  100 
 
 		 349 aa  669    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  51.8 
 
 		 344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  51.8 
 
 		 345 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  51.34 
 
 		 346 aa  302  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  53.62 
 
 		 346 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  53.77 
 
 		 346 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  52.44 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  52.96 
 
 		 346 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  48.64 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  56.21 
 
 		 349 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4294  transport system permease protein  50.48 
 
 		 364 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.1 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  41.88 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3733  transport system permease protein  47.97 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  38.3 
 
 		 367 aa  179  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26530  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.91 
 
 		 345 aa  179  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  39.25 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  42.5 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  41.45 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  37.12 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  39.13 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2173  transport system permease protein  44.29 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0459545  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  37.61 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  37.13 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  35.45 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  36.68 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  39.88 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  39.27 
 
 		 346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  35.9 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  38.25 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  33.54 
 
 		 337 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  41.78 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  33.23 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  38.38 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  38.3 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  41.42 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3933  transport system permease protein  42.82 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  37.72 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  34.76 
 
 		 363 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  38 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  36.62 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  35.41 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  39.51 
 
 		 663 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  36.64 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  35.41 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  43.18 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  37.58 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22090  ABC-type enterobactin transport system, permease component  40.42 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357226  normal  0.153637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  38.41 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  40.2 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  36.36 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  36.36 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  36.36 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  35.95 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  38.25 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  38.25 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  38.25 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  38.25 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  36.06 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  35.76 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  37.95 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  35.76 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  39.8 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  34.37 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  33.03 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  36.06 
 
 		 330 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  32.29 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  36.06 
 
 		 330 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  39.33 
 
 		 347 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  36.98 
 
 		 366 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  41.5 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  39.15 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  32.9 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  33.77 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  36.33 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  32.24 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  36.33 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  32.24 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  32.9 
 
 		 352 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  32.9 
 
 		 352 aa  143  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  32.9 
 
 		 352 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  39.79 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  32.9 
 
 		 352 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  37.5 
 
 		 351 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  37.42 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1395  iron compound ABC transporter, permease protein  30.13 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  30.72 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  36.75 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  38.57 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  36.36 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  37.75 
 
 		 373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  33.44 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.93 
 
 		 678 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  36.21 
 
 		 318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>