More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3524 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  100 
 
 		 346 aa  648    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  78.25 
 
 		 344 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  66.47 
 
 		 346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  66.37 
 
 		 345 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  68.39 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  63.37 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  67.42 
 
 		 346 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  62.76 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4294  transport system permease protein  63.04 
 
 		 364 aa  339  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  53.92 
 
 		 349 aa  301  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  55.59 
 
 		 349 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  42.66 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  45.17 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3733  transport system permease protein  48.16 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2173  transport system permease protein  48.91 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0459545  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  43.28 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26530  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.5 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  39.82 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  39.22 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  38.39 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  40.06 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3933  transport system permease protein  45.09 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  39.87 
 
 		 363 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  39.21 
 
 		 330 aa  166  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  36.92 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  40.53 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  39.81 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  43.02 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  36.59 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  39.54 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  40.69 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  40.85 
 
 		 347 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  36.73 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  39.1 
 
 		 663 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1395  iron compound ABC transporter, permease protein  28.85 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  41.13 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  41.72 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  33.84 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  37.41 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  38.28 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  41.2 
 
 		 394 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  30.15 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  35.85 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  29.85 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  37.71 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  37.71 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  37.71 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  37.71 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  37.71 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  37.71 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  38.8 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  37.71 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  37.71 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  37.16 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  35.37 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  38.94 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  37.79 
 
 		 343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  42.12 
 
 		 350 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  37.88 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  31.42 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  31.42 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  31.42 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  31.42 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  37.88 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  37.88 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  37.88 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  31.72 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  36.97 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  37.58 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  39.07 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 338 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  41.69 
 
 		 343 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2668  transport system permease protein  36.39 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 352 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  31.42 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  40.37 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.01 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  37.32 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  33.01 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.01 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  33.01 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22090  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.67 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357226  normal  0.153637 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  37.46 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 		 352 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  32.35 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.86 
 
 		 704 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  39.81 
 
 		 353 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  34.36 
 
 		 700 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  31.46 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  31.46 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  35.84 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  35.82 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  39.88 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>