More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3784 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  100 
 
 
339 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  78.03 
 
 
319 aa  447  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  74.26 
 
 
339 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  71.18 
 
 
338 aa  401  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  50.86 
 
 
344 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  49.39 
 
 
663 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  48.55 
 
 
339 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  46.79 
 
 
366 aa  236  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  51.22 
 
 
373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  48.84 
 
 
343 aa  225  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  45.7 
 
 
350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.32 
 
 
365 aa  222  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  44.81 
 
 
356 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  45.76 
 
 
330 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  45.76 
 
 
330 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  46.06 
 
 
330 aa  219  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  46.06 
 
 
330 aa  219  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  46.78 
 
 
330 aa  219  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  45.76 
 
 
330 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  45.45 
 
 
330 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  45.45 
 
 
330 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  45.45 
 
 
330 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  44.75 
 
 
355 aa  215  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  46.53 
 
 
360 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  45.15 
 
 
354 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  45.9 
 
 
329 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  45.9 
 
 
329 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  45.9 
 
 
329 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  45.9 
 
 
329 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  45.15 
 
 
330 aa  205  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  45.59 
 
 
329 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  48.3 
 
 
353 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  46.76 
 
 
356 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  46.9 
 
 
363 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  48.08 
 
 
346 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  40.61 
 
 
358 aa  202  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  44.3 
 
 
346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3425  iron-enterobactin transporter permease  50.85 
 
 
341 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  44.67 
 
 
336 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  45.42 
 
 
343 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  44.48 
 
 
367 aa  189  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  48.65 
 
 
350 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  43.02 
 
 
350 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  46.53 
 
 
347 aa  182  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  45.6 
 
 
341 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  41.3 
 
 
355 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  42.56 
 
 
368 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  38.78 
 
 
348 aa  175  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  40.06 
 
 
350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  41.24 
 
 
361 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  45.67 
 
 
346 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  38.21 
 
 
346 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  40.91 
 
 
346 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  40.85 
 
 
346 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  42.72 
 
 
341 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  45.1 
 
 
343 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36330  ABC-type enterobactin transport system, permease component  44.29 
 
 
375 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  40.76 
 
 
345 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.81 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  37.71 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  38.54 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  36.86 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  38.89 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  36.86 
 
 
338 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  36.86 
 
 
338 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 
338 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  36.86 
 
 
338 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 
338 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
338 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 
338 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  44.24 
 
 
342 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  39.13 
 
 
344 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  39.58 
 
 
345 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  35.8 
 
 
338 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  37.83 
 
 
350 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  36.63 
 
 
352 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.63 
 
 
352 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  36.63 
 
 
352 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.63 
 
 
352 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 
352 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  35.97 
 
 
352 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 
352 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  33.66 
 
 
346 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  34.88 
 
 
338 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  33.66 
 
 
346 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  35.22 
 
 
338 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  35.97 
 
 
352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  36.21 
 
 
352 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 
338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1808  transport system permease protein  39.52 
 
 
368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.537054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  33.83 
 
 
338 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  33.83 
 
 
338 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 
338 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  33.83 
 
 
338 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  30.18 
 
 
340 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  35.97 
 
 
352 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  34.23 
 
 
338 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  30.41 
 
 
337 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  41.78 
 
 
366 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>