More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1808 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1808  transport system permease protein  100 
 
 
368 aa  698    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.537054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3298  transport system permease protein  55.72 
 
 
329 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2062  transport system permease protein  48.98 
 
 
361 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2701  transport system permease protein  53.23 
 
 
374 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  38.48 
 
 
350 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  37.83 
 
 
348 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  39.67 
 
 
346 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.05 
 
 
368 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  38.51 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  36.34 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  36.87 
 
 
352 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.87 
 
 
352 aa  173  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  36.87 
 
 
352 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  35.94 
 
 
319 aa  173  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 
352 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  36.16 
 
 
366 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.87 
 
 
352 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 
352 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  35.19 
 
 
351 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  36.09 
 
 
352 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 
352 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 
352 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 
352 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  38.87 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  37.78 
 
 
363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  36.82 
 
 
361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4512  transport system permease protein  42.73 
 
 
341 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  40.32 
 
 
312 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  36.73 
 
 
350 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  36.15 
 
 
358 aa  160  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  36.45 
 
 
346 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  36.45 
 
 
346 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  38.66 
 
 
326 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
338 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
338 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  35.4 
 
 
338 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  35.69 
 
 
338 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  35.69 
 
 
338 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  35.69 
 
 
338 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  35.4 
 
 
338 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  35.89 
 
 
321 aa  156  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 
338 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  35.82 
 
 
356 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2173  transport system permease protein  38.82 
 
 
346 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0459545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  35.67 
 
 
318 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 
338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  33.43 
 
 
355 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  35.95 
 
 
347 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  34.65 
 
 
350 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  36.48 
 
 
355 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  32.52 
 
 
345 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  36.09 
 
 
354 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  35.28 
 
 
322 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  35.28 
 
 
322 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 
342 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  34.02 
 
 
338 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  34.62 
 
 
338 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  38.87 
 
 
344 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  36.31 
 
 
350 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 
340 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  36.07 
 
 
356 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  38.44 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  35.67 
 
 
343 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  32.22 
 
 
345 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  32.22 
 
 
345 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7289  ABC transporter  37.42 
 
 
327 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  38.49 
 
 
366 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  39.37 
 
 
351 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  39.2 
 
 
347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  32.22 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  37.5 
 
 
346 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
342 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  32.81 
 
 
338 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  33.76 
 
 
338 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
338 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  31.64 
 
 
353 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
342 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  37.5 
 
 
346 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  34.31 
 
 
338 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  30.79 
 
 
338 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 
338 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  30.79 
 
 
338 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  37.17 
 
 
339 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 
338 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
338 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1525  transport system permease protein  35.96 
 
 
343 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  38.1 
 
 
343 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  33.12 
 
 
338 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  33.12 
 
 
338 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
338 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  29.7 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  37.41 
 
 
394 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  36.48 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  32.52 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  29.39 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  32.48 
 
 
338 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  40.07 
 
 
358 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  36.2 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>