More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0337 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  100 
 
 
346 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  68.77 
 
 
363 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  54.38 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  53.24 
 
 
356 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  49.26 
 
 
366 aa  278  8e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  51.35 
 
 
356 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  52.11 
 
 
346 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  52.79 
 
 
341 aa  265  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  49.42 
 
 
354 aa  263  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  51.3 
 
 
350 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  51.78 
 
 
343 aa  249  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  46.85 
 
 
350 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  44.31 
 
 
348 aa  242  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  52.41 
 
 
350 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  48.08 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  45.4 
 
 
355 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 
358 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  51.63 
 
 
342 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  43.98 
 
 
368 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  50 
 
 
339 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  50.15 
 
 
347 aa  228  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  48.43 
 
 
344 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  53.67 
 
 
373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  47.09 
 
 
343 aa  226  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  52.82 
 
 
342 aa  225  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  48.08 
 
 
339 aa  222  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  48.18 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  43.24 
 
 
361 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  46.03 
 
 
355 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  45.65 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  45.82 
 
 
367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  46.39 
 
 
360 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  42.03 
 
 
394 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  43.03 
 
 
330 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  43.03 
 
 
330 aa  210  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  43.03 
 
 
330 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  43.03 
 
 
330 aa  210  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  43.03 
 
 
330 aa  210  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  43.03 
 
 
330 aa  209  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  44.41 
 
 
319 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0161393 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  43.54 
 
 
330 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  43.54 
 
 
330 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  43.16 
 
 
330 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  49.27 
 
 
346 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  43.87 
 
 
366 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  44.12 
 
 
329 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  44.12 
 
 
329 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  44.12 
 
 
329 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  44.12 
 
 
329 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  42.23 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  43.82 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  45.7 
 
 
339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  44.87 
 
 
663 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  42.73 
 
 
330 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  44.82 
 
 
347 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06490  ABC-type enterobactin transport system, permease component  45.36 
 
 
371 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  42.77 
 
 
338 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  38.86 
 
 
351 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  47.35 
 
 
353 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  37.66 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  42.76 
 
 
345 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  46.04 
 
 
349 aa  182  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.67 
 
 
356 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  42.64 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2443  ferric enterobactin ABC transporter, permease protein FepG  39.29 
 
 
346 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2542  transport system permease protein  39.29 
 
 
346 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.805909  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  37.96 
 
 
355 aa  179  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3185  ferric enterobactin ABC transporter permease FepG  38.96 
 
 
346 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0655779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3425  iron-enterobactin transporter permease  47.33 
 
 
341 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  33.85 
 
 
340 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36330  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.36 
 
 
375 aa  176  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1808  transport system permease protein  38.87 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.537054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  38.61 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  38.36 
 
 
344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  33.23 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  37.42 
 
 
326 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  33.13 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  33.13 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  33.23 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  33.13 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  34.88 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  38.36 
 
 
350 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  40.12 
 
 
344 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  35.81 
 
 
352 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 
338 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 
338 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  35.19 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  35.19 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  34.88 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  35.19 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2701  transport system permease protein  37.68 
 
 
374 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  42.45 
 
 
346 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  38.92 
 
 
336 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  35.16 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>