More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2743 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  100 
 
 
342 aa  628  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  94.44 
 
 
342 aa  508  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  67.84 
 
 
341 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  50.91 
 
 
365 aa  296  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  53.35 
 
 
354 aa  292  6e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  54.88 
 
 
366 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  51.05 
 
 
363 aa  262  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  52.4 
 
 
356 aa  260  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  50.91 
 
 
356 aa  255  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  52.82 
 
 
346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  53.08 
 
 
350 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  47.25 
 
 
350 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  44.58 
 
 
368 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  51.8 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  49.1 
 
 
350 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  48.68 
 
 
341 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  51.8 
 
 
346 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  46.77 
 
 
355 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  47 
 
 
344 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  45.21 
 
 
348 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  47.49 
 
 
394 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  46.42 
 
 
330 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  49.68 
 
 
373 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  43.58 
 
 
358 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  44.12 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  49.04 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  46.75 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  44.56 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  47.56 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  41.84 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  44.15 
 
 
355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  44.98 
 
 
343 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  44.48 
 
 
345 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  45.96 
 
 
330 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  45.96 
 
 
330 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  45.96 
 
 
330 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  45.65 
 
 
330 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  45.96 
 
 
330 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  43.45 
 
 
360 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  45.65 
 
 
330 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  45.34 
 
 
330 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  45.34 
 
 
330 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  48.5 
 
 
346 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  44.41 
 
 
367 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  46.27 
 
 
329 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  46.27 
 
 
329 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  46.27 
 
 
329 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  45.96 
 
 
329 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  45.51 
 
 
330 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  45.96 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  46.62 
 
 
353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  44.59 
 
 
346 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  46.71 
 
 
350 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  43.69 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  45.53 
 
 
347 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  51.16 
 
 
353 aa  195  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  43.13 
 
 
663 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  44.3 
 
 
346 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  41.16 
 
 
344 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  39.39 
 
 
355 aa  189  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3425  iron-enterobactin transporter permease  49.19 
 
 
341 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  45.06 
 
 
343 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  46.47 
 
 
344 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  45.83 
 
 
347 aa  186  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  45.95 
 
 
338 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4294  transport system permease protein  44.14 
 
 
364 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  37.66 
 
 
349 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  36.31 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  36.31 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  36.31 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  36.31 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  36.31 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  45.03 
 
 
349 aa  180  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  38.51 
 
 
346 aa  179  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 
338 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
338 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  35.33 
 
 
338 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 
338 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 
338 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3733  transport system permease protein  46.52 
 
 
371 aa  176  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3527  transport system permease protein  41.03 
 
 
347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369095  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  35.03 
 
 
338 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  38.84 
 
 
323 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 
352 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  44.01 
 
 
339 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  41.84 
 
 
346 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.33 
 
 
352 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  30.77 
 
 
337 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  35.26 
 
 
352 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36330  ABC-type enterobactin transport system, permease component  43.41 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  34.94 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  35.26 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  34.94 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  34.94 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  30.47 
 
 
337 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  35.16 
 
 
353 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.74 
 
 
678 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  34.69 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>