More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00556 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  100 
 
 
330 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  99.09 
 
 
330 aa  630  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  99.09 
 
 
330 aa  630  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  98.48 
 
 
330 aa  627  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  99.09 
 
 
330 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  98.48 
 
 
330 aa  628  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  99.09 
 
 
330 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  97.58 
 
 
330 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  84.85 
 
 
330 aa  518  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  86.63 
 
 
329 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  86.93 
 
 
329 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  86.93 
 
 
329 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  86.93 
 
 
329 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  86.63 
 
 
329 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3425  iron-enterobactin transporter permease  66.78 
 
 
341 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  58 
 
 
344 aa  298  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  55.48 
 
 
343 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  57.95 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  45.76 
 
 
339 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  45.39 
 
 
365 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  46.91 
 
 
355 aa  248  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  46.48 
 
 
366 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  53.9 
 
 
373 aa  245  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  48.52 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  43.9 
 
 
356 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  46 
 
 
356 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  47.68 
 
 
663 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  46.5 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  44.08 
 
 
350 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  43.03 
 
 
358 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  42.86 
 
 
348 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  50.66 
 
 
350 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  43.73 
 
 
363 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  47.1 
 
 
339 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  44.48 
 
 
346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  49 
 
 
350 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  43.85 
 
 
338 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  44.37 
 
 
346 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  45.51 
 
 
353 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  43.56 
 
 
360 aa  208  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  42.38 
 
 
336 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  48.33 
 
 
343 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  39.16 
 
 
350 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 
352 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  40.06 
 
 
368 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 
352 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  36.25 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.25 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.25 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  36.25 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36330  ABC-type enterobactin transport system, permease component  46.81 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  49.15 
 
 
343 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  42.3 
 
 
345 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  45.62 
 
 
341 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  35.92 
 
 
352 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  35.6 
 
 
352 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  41.9 
 
 
350 aa  192  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  43.51 
 
 
394 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.67 
 
 
346 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  35.65 
 
 
348 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  43.99 
 
 
366 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  39.67 
 
 
346 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  44.79 
 
 
342 aa  185  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  39.46 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06490  ABC-type enterobactin transport system, permease component  43.52 
 
 
371 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  47.29 
 
 
346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  38.85 
 
 
346 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  45.54 
 
 
347 aa  182  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  39.51 
 
 
361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  35.81 
 
 
338 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  35.81 
 
 
338 aa  178  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  35.81 
 
 
338 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  35.81 
 
 
338 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  35.81 
 
 
338 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  35.81 
 
 
338 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  35.81 
 
 
338 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 
338 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 
338 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  36.67 
 
 
349 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  38.67 
 
 
367 aa  176  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  39.74 
 
 
356 aa  176  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  45.34 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  39.87 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  38.72 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  36.13 
 
 
338 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  35.06 
 
 
338 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  35.71 
 
 
346 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  37.21 
 
 
351 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  38.71 
 
 
345 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  35.71 
 
 
346 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  31.27 
 
 
337 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  29.79 
 
 
345 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  30.96 
 
 
337 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  37.18 
 
 
353 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 
342 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  31 
 
 
340 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26530  ABC-type enterobactin transport system, permease component  39.31 
 
 
345 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>