More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2817 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  100 
 
 		 336 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  42.64 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  42.01 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36330  ABC-type enterobactin transport system, permease component  45.28 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  45.7 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  40.95 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  40.55 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  40.55 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  40.24 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  40.55 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  40.55 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  39.88 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  42.3 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  41.19 
 
 		 356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  42.3 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  41.97 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  42.81 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.35 
 
 		 319 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  37.95 
 
 		 355 aa  182  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  42.14 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 		 358 aa  180  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  43.09 
 
 		 329 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  43.09 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  43.09 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  43.09 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  43.09 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  37.95 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  41.16 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  40.15 
 
 		 339 aa  172  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  39.1 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  39.53 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  41.3 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  41.26 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  44.02 
 
 		 663 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  38.89 
 
 		 353 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  39.47 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  37.99 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  37.98 
 
 		 346 aa  159  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  36.74 
 
 		 348 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  40.55 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  38.87 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  34.95 
 
 		 355 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3425  iron-enterobactin transporter permease  41.38 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  37.31 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  38.04 
 
 		 350 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  36.09 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  37.54 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  34.09 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06490  ABC-type enterobactin transport system, permease component  39.26 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  38.44 
 
 		 394 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  38.87 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  38.96 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  40.54 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  31.85 
 
 		 346 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  33.77 
 
 		 355 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  37.31 
 
 		 361 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  35.97 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  31.89 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  36.27 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  32.5 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  32.5 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  35.64 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  32.5 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  32.19 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3069  ferric enterobactin transport system permease protein FepG  38.81 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.605614  normal  0.369476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  38.67 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  35.62 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.92 
 
 		 678 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  27.03 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.7 
 
 		 678 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  32.5 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  35.31 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.3 
 
 		 678 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.3 
 
 		 678 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.3 
 
 		 678 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.24 
 
 		 704 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  26.73 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  34.06 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.3 
 
 		 678 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.61 
 
 		 678 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2124  transport system permease protein  36.54 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.105948  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  32.86 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  31.46 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  32.17 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  38.39 
 
 		 347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  33.56 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  33.12 
 
 		 319 aa  126  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  34.11 
 
 		 347 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1525  transport system permease protein  33.43 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  36.27 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  33.44 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  31.55 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  33.44 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  33.55 
 
 		 375 aa  123  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01764  ABC-type Fe3+-siderophore transporter  32.48 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>