More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3425 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3425  iron-enterobactin transporter permease  100 
 
 
341 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  65.31 
 
 
330 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  65.12 
 
 
330 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  65.12 
 
 
330 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  64.81 
 
 
330 aa  358  7e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  64.81 
 
 
330 aa  358  7e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  64.81 
 
 
330 aa  358  7e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  64.81 
 
 
330 aa  358  8e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  64.81 
 
 
330 aa  358  8e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  64.81 
 
 
330 aa  358  8e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  65.14 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  65.14 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  65.14 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  64.83 
 
 
329 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  64.83 
 
 
329 aa  351  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  64.81 
 
 
330 aa  346  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  60.67 
 
 
344 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  58.14 
 
 
343 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  58 
 
 
339 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  58.36 
 
 
373 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  48.55 
 
 
366 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  47.42 
 
 
339 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  47.39 
 
 
355 aa  251  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  50.47 
 
 
356 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  44.07 
 
 
365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  45.62 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  49.39 
 
 
354 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  49.83 
 
 
339 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  47.67 
 
 
346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  45.85 
 
 
348 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  46.56 
 
 
350 aa  232  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  49.67 
 
 
663 aa  232  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  45.02 
 
 
363 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  49 
 
 
353 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  47.7 
 
 
356 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  50.62 
 
 
350 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  47.04 
 
 
346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  48.04 
 
 
360 aa  219  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  46.13 
 
 
338 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  44.71 
 
 
358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  49.51 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  49.5 
 
 
343 aa  212  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  45.74 
 
 
350 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  40.71 
 
 
345 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  40.41 
 
 
368 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  42.86 
 
 
336 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  49.66 
 
 
343 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  45.54 
 
 
341 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  39.51 
 
 
338 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  39.21 
 
 
338 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  39.21 
 
 
338 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  39.21 
 
 
338 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  39.21 
 
 
338 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  39.21 
 
 
338 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  39.21 
 
 
338 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  39.21 
 
 
338 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  39.21 
 
 
338 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  45.54 
 
 
347 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  41.31 
 
 
361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  49.52 
 
 
342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  43.14 
 
 
346 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  49.2 
 
 
342 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  38.01 
 
 
346 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36330  ABC-type enterobactin transport system, permease component  45.07 
 
 
375 aa  189  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  43.14 
 
 
346 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  40.51 
 
 
345 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  44.16 
 
 
341 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  39.82 
 
 
338 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  47.8 
 
 
346 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.5 
 
 
356 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  41.46 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  40.94 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  33.76 
 
 
352 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  43.91 
 
 
366 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  33.76 
 
 
352 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  33.76 
 
 
352 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  37.78 
 
 
350 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
352 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  33.12 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.12 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.12 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  33.12 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  38.6 
 
 
338 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26530  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.01 
 
 
345 aa  179  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  36.42 
 
 
348 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  33.44 
 
 
337 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  33.12 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  43.23 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  38.61 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  40.5 
 
 
344 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  33.55 
 
 
345 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
342 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  40.82 
 
 
355 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  37.91 
 
 
343 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  33.23 
 
 
342 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 
342 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  39.93 
 
 
349 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>