More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36330 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_36330  ABC-type enterobactin transport system, permease component  100 
 
 
375 aa  699    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  54.9 
 
 
373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  49.04 
 
 
355 aa  233  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  48.66 
 
 
339 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  47.08 
 
 
344 aa  229  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  44.62 
 
 
336 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  44.17 
 
 
330 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  44.48 
 
 
330 aa  223  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  44.17 
 
 
330 aa  223  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  44.48 
 
 
330 aa  223  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  44.48 
 
 
330 aa  223  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  44.17 
 
 
330 aa  223  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  44.07 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  45.57 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  44.07 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  45.45 
 
 
343 aa  219  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  47.31 
 
 
356 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.46 
 
 
365 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  44.44 
 
 
339 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  44.48 
 
 
329 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  44.48 
 
 
329 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  44.48 
 
 
329 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  43.56 
 
 
330 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  44.48 
 
 
329 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  44.48 
 
 
329 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  45.3 
 
 
350 aa  202  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  49.41 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  43.49 
 
 
360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  43.73 
 
 
354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  46.18 
 
 
663 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  45.1 
 
 
366 aa  195  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  44.08 
 
 
356 aa  189  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  44.15 
 
 
319 aa  186  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  44.48 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  40.27 
 
 
363 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  42.18 
 
 
350 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  46.98 
 
 
346 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  41.46 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  42.69 
 
 
367 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3425  iron-enterobactin transporter permease  46.69 
 
 
341 aa  179  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  43.57 
 
 
341 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  41.25 
 
 
368 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  41.11 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  39.77 
 
 
353 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  38.92 
 
 
358 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  43.81 
 
 
339 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  45.7 
 
 
343 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  44.13 
 
 
338 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  43.3 
 
 
346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  41.01 
 
 
343 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  38.62 
 
 
361 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  42.43 
 
 
394 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  39.81 
 
 
345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  43.79 
 
 
347 aa  156  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  45.45 
 
 
341 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  35.95 
 
 
349 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.86 
 
 
356 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  44.9 
 
 
342 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  39.86 
 
 
344 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  44.18 
 
 
342 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  39.07 
 
 
345 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06490  ABC-type enterobactin transport system, permease component  43.53 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  38 
 
 
346 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  36.81 
 
 
346 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  32.22 
 
 
338 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
338 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  32.22 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  32.22 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  32.22 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.25 
 
 
351 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3069  ferric enterobactin transport system permease protein FepG  37.83 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.605614  normal  0.369476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  39.55 
 
 
366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.29 
 
 
704 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  41.43 
 
 
344 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  35.22 
 
 
355 aa  140  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  38.61 
 
 
346 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  39.94 
 
 
347 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  40.94 
 
 
349 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  32.63 
 
 
338 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  37.06 
 
 
346 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  30.12 
 
 
343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  38.24 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  31.09 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  28.92 
 
 
338 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  28.92 
 
 
338 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  31.14 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  32.59 
 
 
323 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2173  transport system permease protein  41.3 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0459545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  33.58 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26530  ABC-type enterobactin transport system, permease component  37.79 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  28.35 
 
 
340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  27.65 
 
 
328 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  34.75 
 
 
347 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 
325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  26.28 
 
 
337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  29.45 
 
 
340 aa  126  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>