More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4232 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  100 
 
 		 347 aa  656    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  58.26 
 
 		 368 aa  335  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  55.74 
 
 		 361 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  44.71 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  50.7 
 
 		 394 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  45.66 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  48.83 
 
 		 354 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  47.77 
 
 		 366 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  52.44 
 
 		 350 aa  205  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  41.64 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  46.49 
 
 		 346 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  46.84 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  46.34 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  43.51 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  46.15 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  45.78 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  39.63 
 
 		 346 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  42.39 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  49.83 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  42.58 
 
 		 355 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  45.45 
 
 		 346 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  40.14 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  43.47 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  42.42 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  44.41 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  40.97 
 
 		 344 aa  185  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  47.24 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  38.91 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  42.76 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  44.25 
 
 		 342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  39.21 
 
 		 349 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  42.44 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  43.77 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  39.59 
 
 		 358 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  40.48 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  41.41 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  46.11 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  43.99 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  41.23 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3733  transport system permease protein  44.63 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  42.91 
 
 		 343 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  47.9 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4294  transport system permease protein  42.47 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  45.86 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  42.17 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  37.79 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  46.34 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1808  transport system permease protein  35.95 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.537054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  47.18 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  42.86 
 
 		 360 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2173  transport system permease protein  47.22 
 
 		 346 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0459545  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  39.5 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  41.28 
 
 		 339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  35.81 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3527  transport system permease protein  39.3 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  35.88 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  38.62 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  34.85 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  34.85 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  40.36 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26530  ABC-type enterobactin transport system, permease component  43.55 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  37.85 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  38.89 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  38.17 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  40.62 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  36.31 
 
 		 338 aa  159  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  34.85 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  34.85 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  34.85 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  34.85 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  38.91 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  34.85 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  38.65 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  38.96 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  39.21 
 
 		 330 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  38.96 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  38.65 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  38.91 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  38.91 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.31 
 
 		 678 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  32.29 
 
 		 337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4512  transport system permease protein  41.72 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  31.94 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  41.58 
 
 		 663 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  43.53 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2592  transport system permease protein  43.21 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  34.92 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32 
 
 		 678 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  38.34 
 
 		 330 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  33.88 
 
 		 346 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32 
 
 		 678 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32 
 
 		 678 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  33.88 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  30.29 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  30.29 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32 
 
 		 678 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32 
 
 		 678 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32 
 
 		 678 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>