More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4512 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4512  transport system permease protein  100 
 
 		 341 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1808  transport system permease protein  42.73 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.537054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.04 
 
 		 368 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2701  transport system permease protein  43.06 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3298  transport system permease protein  41.82 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  37.2 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  40.06 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  41.72 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  36.15 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  38.64 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  40.68 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  42.7 
 
 		 345 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3527  transport system permease protein  39.59 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  34.51 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2062  transport system permease protein  35.99 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  39.58 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  38.28 
 
 		 367 aa  152  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  39.93 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  36.63 
 
 		 361 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  34.77 
 
 		 349 aa  149  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  42.51 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  36.91 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  37.89 
 
 		 346 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  37.32 
 
 		 354 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  37.08 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  37.66 
 
 		 345 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  39.86 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26530  ABC-type enterobactin transport system, permease component  39.79 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  37.13 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  39.7 
 
 		 356 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  39.19 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  38.65 
 
 		 394 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  34.82 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  36.73 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.54 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  35.71 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  29.57 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  33.23 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  33.01 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  34.33 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  34.3 
 
 		 340 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  34.3 
 
 		 334 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  37.22 
 
 		 346 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  34.3 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 		 334 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  35.33 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  33.98 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  36.93 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2173  transport system permease protein  38.72 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0459545  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  35.31 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 338 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 338 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  32.65 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  32.65 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  32.65 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  29.78 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  33.11 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  29.43 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  29.08 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  33.94 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  34.86 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  30.79 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  31.31 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  34.3 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  36.63 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  35.93 
 
 		 343 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  31.31 
 
 		 338 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  35 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  32.73 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  31.61 
 
 		 338 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  39.18 
 
 		 700 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  30.75 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  31.03 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  30.75 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.72 
 
 		 678 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.06 
 
 		 704 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  31.61 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  33.73 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  31.61 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  35.15 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  32.65 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.33 
 
 		 660 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3733  transport system permease protein  34.95 
 
 		 371 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  31.31 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  33.22 
 
 		 352 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  30.51 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  30.51 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  38.87 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  35.27 
 
 		 345 aa  119  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  38.54 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  32.98 
 
 		 660 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  38.26 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>