More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3527 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3527  transport system permease protein  100 
 
 
347 aa  652    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369095  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  40.68 
 
 
367 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
368 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  39.34 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  36.3 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  39.48 
 
 
361 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  33.81 
 
 
352 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  38.51 
 
 
394 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  32.95 
 
 
352 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  33.52 
 
 
352 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  33.52 
 
 
352 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.52 
 
 
352 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  33.52 
 
 
352 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  33.52 
 
 
352 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  39.31 
 
 
363 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 
352 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.52 
 
 
352 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  33.52 
 
 
352 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  30.82 
 
 
332 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  33.04 
 
 
351 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  30.82 
 
 
332 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  33.82 
 
 
353 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  37.35 
 
 
366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  40.26 
 
 
356 aa  166  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  40.75 
 
 
354 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  35.44 
 
 
365 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  36.86 
 
 
350 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  34.13 
 
 
346 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  35.2 
 
 
319 aa  160  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  34.13 
 
 
346 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  37.2 
 
 
355 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.12 
 
 
356 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.08 
 
 
678 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  36.99 
 
 
323 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  35.46 
 
 
318 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  38.51 
 
 
345 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 
340 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  40.41 
 
 
342 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  37.46 
 
 
346 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.05 
 
 
678 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.73 
 
 
678 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  33.53 
 
 
348 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  38.41 
 
 
700 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.76 
 
 
678 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  38.51 
 
 
345 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  31.5 
 
 
328 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  36 
 
 
355 aa  152  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  36.6 
 
 
344 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  33.84 
 
 
344 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.76 
 
 
678 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.76 
 
 
678 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  36.04 
 
 
344 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  36.71 
 
 
346 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.76 
 
 
678 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  36.22 
 
 
348 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  38.39 
 
 
346 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  30.75 
 
 
321 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  34.57 
 
 
355 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 
358 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  39.04 
 
 
351 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  33 
 
 
328 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  37.17 
 
 
343 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 
325 aa  149  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1525  transport system permease protein  36.39 
 
 
343 aa  149  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4440  iron compound ABC transporter permease  33.23 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.68 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4785  iron compound ABC transporter permease protein  33.23 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  35.27 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  40.99 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  32.21 
 
 
322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  32.21 
 
 
322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4654  iron compound ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
327 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4669  iron compound ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 
327 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 
338 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  34.14 
 
 
338 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  34.14 
 
 
338 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  34.14 
 
 
338 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  34.71 
 
 
338 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  36.39 
 
 
339 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  34.14 
 
 
338 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 
338 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  38.91 
 
 
349 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4659  iron compound ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
338 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4512  transport system permease protein  39.59 
 
 
341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4290  iron compound ABC transporter, permease  32.62 
 
 
327 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0583  iron compound ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 
327 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  34.64 
 
 
338 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4373  transport system permease protein  33.44 
 
 
327 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  39.3 
 
 
347 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4340  iron ABC transporter, permease protein FitD  34.4 
 
 
345 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  33.45 
 
 
338 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4279  iron compound ABC transporter, permease  32.04 
 
 
327 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.551381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  37.93 
 
 
346 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  34.05 
 
 
338 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.74 
 
 
704 aa  143  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  33.21 
 
 
360 aa  143  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  30.97 
 
 
340 aa  143  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  35.48 
 
 
350 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>