More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0852 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  100 
 
 
355 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  60.06 
 
 
367 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  47.35 
 
 
366 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  47.41 
 
 
394 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  43.92 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.98 
 
 
365 aa  229  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  44.51 
 
 
368 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  42.54 
 
 
361 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  42.43 
 
 
363 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  46.35 
 
 
346 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  43.91 
 
 
356 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  47.12 
 
 
345 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  43.16 
 
 
354 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  43.79 
 
 
341 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  39.77 
 
 
350 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4041  transport system permease protein  39.23 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  41.97 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  42.17 
 
 
355 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  42.11 
 
 
356 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  46.18 
 
 
343 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  38.91 
 
 
346 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  39.33 
 
 
358 aa  192  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  44.87 
 
 
342 aa  192  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  40 
 
 
345 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  39.66 
 
 
348 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  38.59 
 
 
346 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  33.63 
 
 
337 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  41.78 
 
 
339 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
352 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  33.63 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  37.06 
 
 
352 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  38.85 
 
 
352 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  38.85 
 
 
352 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  42.26 
 
 
341 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
352 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
352 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  38.85 
 
 
352 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  38.85 
 
 
352 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  46.41 
 
 
350 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  38.35 
 
 
346 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 
352 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  38.28 
 
 
350 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  42.63 
 
 
346 aa  185  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  42.81 
 
 
339 aa  185  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  40.14 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  36.83 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  41.85 
 
 
343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  37.13 
 
 
349 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4905  transport system permease protein  48.25 
 
 
349 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  41.9 
 
 
351 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  38.78 
 
 
346 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  38.78 
 
 
346 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  44.44 
 
 
342 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  41.76 
 
 
347 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  37.99 
 
 
326 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  39.63 
 
 
330 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  37.77 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  40.19 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  40.06 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  40.18 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  37.85 
 
 
348 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.37 
 
 
373 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  43.47 
 
 
351 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  36.74 
 
 
344 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  45.16 
 
 
353 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  36.47 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  36.47 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  36.47 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  36.47 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  40.25 
 
 
329 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  40.25 
 
 
329 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  40.25 
 
 
329 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  40.25 
 
 
329 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  38.55 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  39.94 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.47 
 
 
356 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  38.55 
 
 
330 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  38.55 
 
 
330 aa  166  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2592  transport system permease protein  42.12 
 
 
343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  39.32 
 
 
330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  41.29 
 
 
343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  39.32 
 
 
330 aa  165  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  39.32 
 
 
330 aa  165  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  36.17 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  37.63 
 
 
663 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  38.55 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  42.62 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  38.55 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1041  transport system permease protein  40.31 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  35.06 
 
 
338 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 
338 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  45.27 
 
 
347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  35.37 
 
 
338 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 
338 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  38.35 
 
 
346 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1525  transport system permease protein  42.02 
 
 
343 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  35.6 
 
 
336 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>