More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4905 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4905  transport system permease protein  100 
 
 		 349 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  47.02 
 
 		 367 aa  213  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  48.55 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  46.78 
 
 		 394 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  40.18 
 
 		 363 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  41.47 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  41.96 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  43.06 
 
 		 341 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  45.19 
 
 		 366 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  39 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  42.14 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  37.16 
 
 		 365 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  34.12 
 
 		 353 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  41.94 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  34.42 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  40.71 
 
 		 373 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  34.42 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  36.63 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  40.8 
 
 		 368 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  37.85 
 
 		 350 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  40.55 
 
 		 356 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  36.31 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  38.96 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  36.47 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  36.47 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  36.47 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  36.47 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  37.81 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  36.31 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  35.54 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  36.08 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  45.43 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  39.47 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  36.54 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  44.77 
 
 		 342 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.75 
 
 		 678 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.98 
 
 		 678 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.98 
 
 		 678 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.98 
 
 		 678 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  35.74 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  41.7 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.56 
 
 		 678 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  33.93 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.46 
 
 		 678 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  39.81 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  43.13 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  30.67 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  36.52 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  33.63 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  33.93 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  39.93 
 
 		 318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  40.23 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.69 
 
 		 678 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  30.65 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  34.29 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  36.65 
 
 		 348 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  39.2 
 
 		 355 aa  152  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  33.93 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  38.07 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  33.63 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  33.63 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  38.78 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  38.39 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  33.97 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.97 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.97 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  33.97 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  40.34 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  38.86 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  37 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  39.47 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  33.83 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4041  transport system permease protein  34.11 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  33.83 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  30.18 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4340  iron ABC transporter, permease protein FitD  34.57 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  39.06 
 
 		 355 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  33.68 
 
 		 367 aa  149  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  32.32 
 
 		 330 aa  149  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  32.71 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  32.71 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3320  iron ABC transporter, permease protein FitD  34.57 
 
 		 349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0698736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.73 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  38.84 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1525  transport system permease protein  39.19 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  37.29 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.33 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1047  transport system permease protein  36.25 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>