More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4041 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4041  transport system permease protein  100 
 
 		 411 aa  766    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  39.8 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  39.64 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  35.64 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  36.92 
 
 		 356 aa  192  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  37.15 
 
 		 361 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  38.14 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  40.84 
 
 		 346 aa  179  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  41.06 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  38.98 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  36.92 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  34.84 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  33.85 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  33.78 
 
 		 350 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  32.41 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  32.41 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  32.41 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  31.9 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  36.53 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  32.15 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  32.15 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  33.76 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  36.68 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  32.15 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  32.23 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  32.17 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  33.59 
 
 		 366 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  31.98 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  34.17 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  33.24 
 
 		 365 aa  156  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  34.89 
 
 		 346 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  34.62 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  35.34 
 
 		 345 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  36.29 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  37.67 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  37.27 
 
 		 341 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  33.24 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  30.46 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  41.79 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  30.46 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  33.7 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4905  transport system permease protein  38.71 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  35.01 
 
 		 344 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  34.38 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  28.49 
 
 		 338 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  28.49 
 
 		 338 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  28.49 
 
 		 338 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  28.49 
 
 		 338 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  28.49 
 
 		 338 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  41.69 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  29.03 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  35.14 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  27.13 
 
 		 337 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  34.63 
 
 		 347 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  26.86 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  32.79 
 
 		 356 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  36.27 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  31.76 
 
 		 355 aa  136  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  33.68 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  32.89 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1813  transport system permease protein  37.06 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  31.79 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2592  transport system permease protein  33.33 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  38.95 
 
 		 346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  34.04 
 
 		 350 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  35.67 
 
 		 356 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3733  transport system permease protein  37.33 
 
 		 371 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2668  transport system permease protein  32.97 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  35.25 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1525  transport system permease protein  37.13 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  35.53 
 
 		 343 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2938  transport system permease protein  38.62 
 
 		 343 aa  127  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  35.43 
 
 		 330 aa  126  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  36.96 
 
 		 343 aa  126  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  35.43 
 
 		 330 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  35.28 
 
 		 353 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  30.9 
 
 		 339 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  35.74 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  35.8 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  35.74 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06490  ABC-type enterobactin transport system, permease component  33.43 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  30.41 
 
 		 344 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  35.04 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  35.04 
 
 		 330 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  35.04 
 
 		 330 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  28.32 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  29.28 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  33.91 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  35.34 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  33.91 
 
 		 329 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  28.61 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  33.91 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  28.88 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>