More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1813 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1813  transport system permease protein  100 
 
 
351 aa  692    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  48.95 
 
 
338 aa  341  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  48.95 
 
 
338 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  49.55 
 
 
338 aa  341  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  48.95 
 
 
338 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  48.95 
 
 
338 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  48.95 
 
 
338 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  48.95 
 
 
338 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  48.95 
 
 
338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  49.25 
 
 
338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  48.95 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  48.95 
 
 
338 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1967  transport system permease protein  55.79 
 
 
331 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000863447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  43.94 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  43.94 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4922  iron compound ABC transporter, permease protein  49.1 
 
 
335 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311941  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  42.94 
 
 
338 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  44.86 
 
 
338 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  44.86 
 
 
338 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  44.55 
 
 
338 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  44.86 
 
 
338 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  44.24 
 
 
338 aa  296  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  44.86 
 
 
338 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  44.55 
 
 
338 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  43.93 
 
 
338 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  41.72 
 
 
340 aa  295  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0329  transport system permease protein  48.19 
 
 
335 aa  295  9e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  43.93 
 
 
338 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  42.31 
 
 
340 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  42.6 
 
 
340 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  42.69 
 
 
337 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0328  transport system permease protein  47.87 
 
 
336 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  42.01 
 
 
340 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  42.39 
 
 
337 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  41.42 
 
 
340 aa  289  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  41.42 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  41.42 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  41.42 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  41.42 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  41.42 
 
 
340 aa  289  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  41.42 
 
 
340 aa  288  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0445  iron compound ABC transporter, permease protein  48.34 
 
 
335 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0396  iron compound ABC transporter, permease protein  47.29 
 
 
335 aa  285  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0321  ferrichrome transport system permease  47.43 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0449  iron compound ABC transporter, permease protein  47.73 
 
 
335 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0334  iron compound ABC transporter permease  47.43 
 
 
335 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0349  iron compound ABC transporter permease protein  47.43 
 
 
335 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.601637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0381  iron compound ABC transporter, permease protein  47.43 
 
 
335 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0318  ferrichrome transport system permease  47.43 
 
 
335 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0507697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1047  transport system permease protein  44.98 
 
 
329 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1395  iron compound ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  40.95 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  41.35 
 
 
344 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  39.49 
 
 
352 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  39.81 
 
 
352 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  39.81 
 
 
352 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  39.81 
 
 
352 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  42.74 
 
 
351 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  39.81 
 
 
352 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  39.49 
 
 
352 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 
352 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  39.49 
 
 
352 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  39.43 
 
 
348 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  39.17 
 
 
352 aa  228  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  38.29 
 
 
346 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  38.29 
 
 
346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  43.63 
 
 
346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  35.85 
 
 
361 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  36 
 
 
370 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  37.24 
 
 
376 aa  202  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  36.83 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.22 
 
 
337 aa  198  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  41.5 
 
 
318 aa  199  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  37.04 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  38.81 
 
 
341 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  35.33 
 
 
371 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  37.34 
 
 
330 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  40 
 
 
356 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  38.95 
 
 
358 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 
340 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  34.02 
 
 
368 aa  192  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  36.02 
 
 
370 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  36.58 
 
 
347 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  36.48 
 
 
322 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  37.46 
 
 
332 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  37.85 
 
 
345 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  36.48 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  40.61 
 
 
325 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  39.72 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  34.17 
 
 
328 aa  189  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  39.1 
 
 
323 aa  189  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  39.64 
 
 
315 aa  189  8e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  36.39 
 
 
326 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  34.72 
 
 
350 aa  188  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.58 
 
 
330 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  35.71 
 
 
333 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  37.54 
 
 
354 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  36.68 
 
 
328 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  37.39 
 
 
319 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>