More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1806 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  100 
 
 		 350 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  71.99 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  58.36 
 
 		 348 aa  358  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  56.27 
 
 		 350 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  67.69 
 
 		 346 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  50.45 
 
 		 358 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  53.82 
 
 		 346 aa  278  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  52.49 
 
 		 350 aa  278  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  47.93 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  50.87 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  52.41 
 
 		 347 aa  256  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  50 
 
 		 363 aa  249  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  53.62 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  47.66 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  50.97 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  52.92 
 
 		 343 aa  235  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  46.73 
 
 		 356 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  50.65 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  48.44 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  50.71 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  52.41 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  44.71 
 
 		 355 aa  219  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  50 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  43.02 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  50.99 
 
 		 329 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  50.99 
 
 		 329 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  50.99 
 
 		 329 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  50.99 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  50.99 
 
 		 329 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  50.99 
 
 		 330 aa  212  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  50.99 
 
 		 330 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  50.99 
 
 		 330 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  48.18 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  50.66 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  50.66 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  50.66 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  50.66 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  50.66 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  48.24 
 
 		 341 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  48.09 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  42.43 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  50.6 
 
 		 342 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.59 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  50.98 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  45.96 
 
 		 663 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  41.14 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  50 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  41.35 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3425  iron-enterobactin transporter permease  50.33 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  42.9 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  45.58 
 
 		 339 aa  185  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  42.74 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  44.52 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  34.74 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  36.48 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  34.35 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  36.16 
 
 		 338 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  42.35 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  38.29 
 
 		 355 aa  175  9e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  36.16 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  42.56 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  36.16 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  45.31 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  43.15 
 
 		 347 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  42.81 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  42.94 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  41.45 
 
 		 349 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  38.99 
 
 		 350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  40.19 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  35.82 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  35.91 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  38.46 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  36.36 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  42 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  35.82 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  35.61 
 
 		 346 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  35.82 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  35.82 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  35.82 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  35.82 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  35.82 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  35.82 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36330  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.06 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4294  transport system permease protein  43.03 
 
 		 364 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  33.83 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  38.02 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  34.31 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 		 352 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  41.75 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  32.39 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  32.55 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 		 352 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  32.84 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  32.84 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>