More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1496 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  100 
 
 
343 aa  657    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  77.22 
 
 
344 aa  435  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  70.72 
 
 
339 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  55.15 
 
 
330 aa  287  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  52.58 
 
 
330 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  52.58 
 
 
330 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  52.58 
 
 
330 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  52.58 
 
 
330 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  52.58 
 
 
330 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  52.58 
 
 
330 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  52.58 
 
 
330 aa  280  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  52.58 
 
 
330 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  52.89 
 
 
330 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  54.15 
 
 
329 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  54.15 
 
 
329 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  54.15 
 
 
329 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  53.85 
 
 
329 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  53.85 
 
 
329 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  55.88 
 
 
373 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3425  iron-enterobactin transporter permease  58.14 
 
 
341 aa  252  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  46.56 
 
 
355 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  47 
 
 
348 aa  245  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  47.17 
 
 
366 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  48.63 
 
 
360 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  49.68 
 
 
353 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  46.95 
 
 
663 aa  242  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  49.17 
 
 
339 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  47.84 
 
 
350 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  44.04 
 
 
356 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  46.43 
 
 
319 aa  235  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  48.01 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.9 
 
 
365 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  44.01 
 
 
358 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  47.16 
 
 
346 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  43.17 
 
 
363 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  48.82 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  45.37 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  45.65 
 
 
338 aa  219  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  46.67 
 
 
356 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  47.71 
 
 
341 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  46.22 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  49.67 
 
 
350 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  44.88 
 
 
354 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  47.12 
 
 
346 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.82 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  46.82 
 
 
347 aa  199  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  47.6 
 
 
343 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36330  ABC-type enterobactin transport system, permease component  47.46 
 
 
375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  47.37 
 
 
343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  39.41 
 
 
361 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  47.27 
 
 
341 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  39.8 
 
 
336 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  38.91 
 
 
367 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  44.98 
 
 
342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  44.68 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  42.04 
 
 
355 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  40.71 
 
 
394 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  40.2 
 
 
349 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  41.67 
 
 
366 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  37.95 
 
 
356 aa  175  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06490  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.34 
 
 
371 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  41.29 
 
 
346 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  38.83 
 
 
344 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  37.96 
 
 
346 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  40.78 
 
 
346 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 
352 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  36.59 
 
 
352 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.59 
 
 
352 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  36.59 
 
 
352 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 
352 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.59 
 
 
352 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  38.24 
 
 
345 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 
352 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  39.56 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
338 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
338 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  35.06 
 
 
338 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  35.06 
 
 
338 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  35.06 
 
 
338 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  35.33 
 
 
352 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  35.06 
 
 
338 aa  162  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
338 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 
338 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 
338 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  38.34 
 
 
345 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  34.93 
 
 
338 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  35.89 
 
 
344 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 
325 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  30.18 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  35.69 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  41.33 
 
 
353 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  30.18 
 
 
337 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  32.17 
 
 
319 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  34.64 
 
 
338 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  38.96 
 
 
347 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1493  putative ferrichrome transport system permease protein  37.87 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0887097  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
343 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  33.53 
 
 
348 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>