More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06490 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06490  ABC-type enterobactin transport system, permease component  100 
 
 		 371 aa  692    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1493  putative ferrichrome transport system permease protein  51.32 
 
 		 346 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0887097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3069  ferric enterobactin transport system permease protein FepG  50.45 
 
 		 346 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.605614  normal  0.369476 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2542  transport system permease protein  46.18 
 
 		 346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.805909  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2443  ferric enterobactin ABC transporter, permease protein FepG  46.18 
 
 		 346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3185  ferric enterobactin ABC transporter permease FepG  45.83 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0655779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  46.89 
 
 		 356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0140  iron-siderophore ABC transporter, membrane permease component  40.88 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2928  transport system permease protein  51.2 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.77 
 
 		 365 aa  205  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  46.05 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  44.95 
 
 		 363 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  47.02 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  48.99 
 
 		 343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  45.75 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  41.99 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  45.06 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  40.65 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  43.55 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  40.98 
 
 		 368 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  47.21 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  45.07 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  44.64 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  44.64 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  37.42 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  44.29 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  44.29 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  44.33 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  44.33 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  43.99 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  42.47 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  43.99 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  45.99 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  39.75 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  41.23 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  42.24 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  41.83 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  45.22 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  41.35 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  40.89 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  37.3 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  44.29 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  47.62 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  40.6 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  39.4 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  41.21 
 
 		 394 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  40.69 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  41.64 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  42.56 
 
 		 329 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  35.81 
 
 		 346 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  42.56 
 
 		 329 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  42.56 
 
 		 329 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  42.56 
 
 		 329 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  36.45 
 
 		 344 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  41.21 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.23 
 
 		 678 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  42.21 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  38.02 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.04 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  37.25 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  39.54 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  45.1 
 
 		 373 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.61 
 
 		 678 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  37.38 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  41.29 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.61 
 
 		 678 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.82 
 
 		 678 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.82 
 
 		 678 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.82 
 
 		 678 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  41.38 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  33.44 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.82 
 
 		 678 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  34.7 
 
 		 350 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  32.9 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  32.9 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  32.9 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  38.71 
 
 		 345 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  32.9 
 
 		 352 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  35.86 
 
 		 319 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  32.62 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  32.62 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  31.46 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  43.89 
 
 		 663 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  32.33 
 
 		 338 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  35.42 
 
 		 346 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  35.42 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  32.33 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  32.33 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 		 352 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  32.02 
 
 		 338 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  43.05 
 
 		 347 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>