More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3185 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3185  ferric enterobactin ABC transporter permease FepG  100 
 
 
346 aa  670    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0655779 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2443  ferric enterobactin ABC transporter, permease protein FepG  99.13 
 
 
346 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2542  transport system permease protein  99.42 
 
 
346 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.805909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0140  iron-siderophore ABC transporter, membrane permease component  43.2 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06490  ABC-type enterobactin transport system, permease component  45.83 
 
 
371 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1493  putative ferrichrome transport system permease protein  40.77 
 
 
346 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0887097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  39.66 
 
 
363 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  35.76 
 
 
366 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  39.8 
 
 
346 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3069  ferric enterobactin transport system permease protein FepG  37.91 
 
 
346 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.605614  normal  0.369476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  38.14 
 
 
356 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  38.11 
 
 
354 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  34.84 
 
 
365 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  32.9 
 
 
346 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  36.45 
 
 
356 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 
358 aa  149  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  33.85 
 
 
355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2928  transport system permease protein  41.24 
 
 
368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  36.64 
 
 
361 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  34.9 
 
 
355 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  34.24 
 
 
339 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  36.96 
 
 
350 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  34.71 
 
 
368 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  36.95 
 
 
346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  38.03 
 
 
350 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  34.8 
 
 
319 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  33.21 
 
 
348 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  35.15 
 
 
339 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.68 
 
 
678 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.11 
 
 
678 aa  135  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  36.46 
 
 
353 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  34.47 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  36.93 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.11 
 
 
678 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  37.94 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.33 
 
 
678 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.33 
 
 
678 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.33 
 
 
678 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  36.15 
 
 
347 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.33 
 
 
678 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  34.32 
 
 
394 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01764  ABC-type Fe3+-siderophore transporter  34.33 
 
 
327 aa  132  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  35.12 
 
 
350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  36.57 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  34 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  35.96 
 
 
350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  33.67 
 
 
338 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  35.03 
 
 
353 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  33.67 
 
 
338 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
338 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  33.33 
 
 
338 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  33.33 
 
 
338 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  36.64 
 
 
343 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
338 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  31.72 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  34.8 
 
 
346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  33.33 
 
 
338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  36.03 
 
 
343 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  37.12 
 
 
350 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  34.33 
 
 
338 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  34.94 
 
 
338 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  34.11 
 
 
352 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  35.44 
 
 
326 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 
352 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 
352 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  34.11 
 
 
352 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  34.11 
 
 
352 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  33.78 
 
 
352 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  34.11 
 
 
352 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4922  iron compound ABC transporter, permease protein  34.12 
 
 
335 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311941  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  35.19 
 
 
351 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
352 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  37.55 
 
 
339 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 
321 aa  123  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1808  transport system permease protein  32.77 
 
 
368 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.537054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  36.59 
 
 
355 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  34.24 
 
 
341 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  33.13 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0329  transport system permease protein  34.9 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  33.13 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  38.7 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  33.78 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04154  iron-dicitrate transporter subunit  33.93 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  36.3 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  35.21 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  33.33 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4865  iron-dicitrate transporter subunit FecD  33.93 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04117  hypothetical protein  33.93 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  35.56 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0740  iron-dicitrate transporter subunit FecD  33.93 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3712  transport system permease protein  33.93 
 
 
318 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  37.03 
 
 
343 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  35.54 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  33.44 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  35.54 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0761  iron-compound ABC transporter, permease protein  36.49 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  33.69 
 
 
323 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  32.69 
 
 
375 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 
325 aa  119  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>