More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06008 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001070  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuC  59.15 
 
 		 307 aa  355  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  46.11 
 
 		 358 aa  275  6e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  45.6 
 
 		 333 aa  245  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0762  iron(III) dicitrate transport system, permease protein FecC  46.15 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  39.27 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0666  iron-dicitrate transporter permease subunit  45.02 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.978539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  40.66 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  41.4 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  40.92 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  40.65 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  40.92 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04155  iron-dicitrate transporter subunit  42.81 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3711  transport system permease protein  42.81 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4866  iron-dicitrate transporter permease subunit  42.81 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04118  hypothetical protein  42.81 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  37.9 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3187  transport system permease protein  36.59 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.117806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0741  iron-dicitrate transporter permease subunit  42.48 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1774  iron compound ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000671836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  38.22 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  37.9 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3190  ferrichrome transport system permease  36.62 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000029437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  38.22 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3487  iron compound ABC transporter, permease protein  36.92 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000659381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3277  iron compound ABC transporter permease  36.89 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3247  ferrichrome transport system permease  36.89 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.1926e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3534  iron compound ABC transporter permease protein  36.89 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3504  iron compound ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  41.61 
 
 		 329 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3491  iron compound ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 		 298 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  37.9 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  41.18 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  40.91 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3474  iron compound ABC transporter, permease protein  37.2 
 
 		 344 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.712456  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  40.5 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  37.15 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  37.15 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0973  iron-dicitrate transporter permease subunit  39.02 
 
 		 331 aa  189  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.667352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  39.18 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  38.83 
 
 		 340 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  38.83 
 
 		 334 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  39.18 
 
 		 340 aa  185  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.14 
 
 		 351 aa  185  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  34.58 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  42.31 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40 
 
 		 374 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  39.38 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1042  transport system permease protein  41.82 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  37.05 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  39.4 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  36.99 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  36.99 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  36.74 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  37 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  42.61 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  39.51 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  39.31 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  40.14 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  35.42 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  39.31 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  36.03 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  38.41 
 
 		 367 aa  175  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  34.27 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  39.87 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  39.25 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  41.07 
 
 		 353 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  39.01 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  33.33 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4341  iron ABC transporter, permease protein FitC  40.43 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 		 352 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3321  iron ABC transporter, permease protein FitC  40.43 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  32.99 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  32.99 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  32.99 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  38.52 
 
 		 351 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  40.8 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  35.54 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  37.67 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  31.87 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.37 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  41.31 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  39.66 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  39.66 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  39.66 
 
 		 352 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  40 
 
 		 352 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  39.66 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  35.74 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  35.74 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  39.66 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>