More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1629 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  100 
 
 		 350 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  53.74 
 
 		 358 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  54.87 
 
 		 348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  50.3 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  52.49 
 
 		 350 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  53.13 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  54.42 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  53.47 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  50.93 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  45.4 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  44.48 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  44.31 
 
 		 363 aa  228  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  49.01 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  46.43 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  45.65 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  46.23 
 
 		 343 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  47.5 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  45.76 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  48.66 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  45.33 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  43.25 
 
 		 330 aa  202  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  44.08 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  38.18 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  44.84 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  41.34 
 
 		 330 aa  190  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  42.9 
 
 		 329 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.931456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  41.34 
 
 		 330 aa  189  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  42.9 
 
 		 329 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  41.34 
 
 		 330 aa  189  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  41.34 
 
 		 330 aa  189  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  41.34 
 
 		 330 aa  189  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  41.34 
 
 		 330 aa  189  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  42.9 
 
 		 329 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  42.9 
 
 		 329 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  42.42 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  46.36 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  41.64 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  41.12 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  41.64 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  43.77 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  39.56 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  41.95 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  44.66 
 
 		 373 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  37.13 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  46.71 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  40.34 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  41.93 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3425  iron-enterobactin transporter permease  44.95 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  44.91 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  39.1 
 
 		 394 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  39.3 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.18 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  41.61 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  39 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  37.38 
 
 		 349 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  33.94 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36330  ABC-type enterobactin transport system, permease component  43.61 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  32.44 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  32.44 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  32.44 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  41.99 
 
 		 663 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  32.44 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  32.44 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  32.44 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  32.44 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  32.44 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  38.9 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  36.76 
 
 		 351 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  38.14 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  36.96 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1808  transport system permease protein  36.55 
 
 		 368 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.537054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  41.24 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  32.65 
 
 		 338 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  38.24 
 
 		 345 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  36.76 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  36.74 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  38.74 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  44 
 
 		 353 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  33.75 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.26 
 
 		 678 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  32.55 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  33.03 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  33.03 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  33.03 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  35.53 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  32.93 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  32.63 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.26 
 
 		 678 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  32.73 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  36.46 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  29.07 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  36.46 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.95 
 
 		 678 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  34.11 
 
 		 348 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.45 
 
 		 346 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>