More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0426 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  100 
 
 		 355 aa  666    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.46 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  40.91 
 
 		 354 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  38.94 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  35.64 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  37.97 
 
 		 349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  37.73 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  40.43 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  35.45 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  39.25 
 
 		 366 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  35.42 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  35.42 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  35.42 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  35.42 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  35.04 
 
 		 353 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  36.18 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  40.68 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  38.14 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3733  transport system permease protein  45.02 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  39.65 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 		 352 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  38.46 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  35.24 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26530  ABC-type enterobactin transport system, permease component  39.02 
 
 		 345 aa  156  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  35.24 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  37.13 
 
 		 346 aa  156  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  37.67 
 
 		 346 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  34.82 
 
 		 338 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4294  transport system permease protein  38.02 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  34.64 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  34.64 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  34.64 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  34.64 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  36.91 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  38.33 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1813  transport system permease protein  39.76 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  37.58 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  34.04 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  34.04 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  35.12 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  38.29 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  38.46 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  37 
 
 		 346 aa  153  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  35.05 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  37.22 
 
 		 356 aa  149  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  35.46 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  32.69 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  33.56 
 
 		 346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  33.75 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  33.75 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  32.36 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  36.54 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2173  transport system permease protein  42.27 
 
 		 346 aa  145  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0459545  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  34.31 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  37.91 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  34.69 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  36.42 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  35.05 
 
 		 338 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  34.74 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  34.74 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  34.37 
 
 		 367 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  30.11 
 
 		 362 aa  142  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 		 338 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 		 338 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  30.46 
 
 		 360 aa  142  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  35.91 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2542  transport system permease protein  35.15 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.805909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  36.78 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2443  ferric enterobactin ABC transporter, permease protein FepG  35.15 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  33.94 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3185  ferric enterobactin ABC transporter permease FepG  35.15 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0655779 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4922  iron compound ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  37.09 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  37.79 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.4 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  34.06 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  33.92 
 
 		 350 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  35.71 
 
 		 356 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.95 
 
 		 678 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.09 
 
 		 678 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0449  iron compound ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  37.95 
 
 		 355 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3527  transport system permease protein  36 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0328  transport system permease protein  35.64 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1808  transport system permease protein  33.43 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.537054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  33.84 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  35.71 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  32 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>