More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2173 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2173  transport system permease protein  100 
 
 
346 aa  635    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0459545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  41.54 
 
 
346 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  48.32 
 
 
346 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  48.32 
 
 
346 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  43.09 
 
 
344 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  44.97 
 
 
346 aa  202  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  44.18 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  45.05 
 
 
349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  43.93 
 
 
344 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  40.19 
 
 
366 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  43.33 
 
 
368 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  42.2 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4294  transport system permease protein  46.06 
 
 
364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  44 
 
 
361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  39.17 
 
 
365 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  43.83 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  40.37 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  43 
 
 
354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  46.98 
 
 
347 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  39.39 
 
 
339 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  39.44 
 
 
330 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  40.06 
 
 
355 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  40 
 
 
356 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1808  transport system permease protein  38.96 
 
 
368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.537054  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  41.78 
 
 
346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  45.51 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  40.71 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  38.18 
 
 
350 aa  162  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  38.61 
 
 
355 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  38.54 
 
 
319 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  41.24 
 
 
363 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  39.05 
 
 
339 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
352 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  40.35 
 
 
663 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 
352 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  36.54 
 
 
352 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 
352 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  39.82 
 
 
367 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  41.8 
 
 
341 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 
352 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  36.86 
 
 
352 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.86 
 
 
352 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  36.86 
 
 
352 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.86 
 
 
352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  43.06 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 
352 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  44.67 
 
 
345 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  39.08 
 
 
330 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  39.08 
 
 
330 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  39.08 
 
 
330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  38.77 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  38.77 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  37.1 
 
 
350 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  38.77 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  40.73 
 
 
329 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  40.73 
 
 
329 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  40.73 
 
 
329 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  40.73 
 
 
329 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  38.46 
 
 
330 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  43.1 
 
 
366 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  42.91 
 
 
394 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  37.21 
 
 
318 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  43.19 
 
 
350 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  38.46 
 
 
330 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  35.35 
 
 
353 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  29.2 
 
 
337 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26530  ABC-type enterobactin transport system, permease component  39.6 
 
 
345 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  40.4 
 
 
329 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  40.71 
 
 
346 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  28.91 
 
 
337 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3733  transport system permease protein  45.26 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 
325 aa  146  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  38.2 
 
 
330 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  42.14 
 
 
342 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 
343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  31.38 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  33.95 
 
 
326 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3298  transport system permease protein  39.81 
 
 
329 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 
358 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  41.25 
 
 
347 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  40.79 
 
 
343 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  34.4 
 
 
373 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  30.38 
 
 
340 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  32.52 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  32.52 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  32.52 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  32.52 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2701  transport system permease protein  35.99 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  40.07 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  37.75 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  33.12 
 
 
322 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  33.12 
 
 
322 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  36.88 
 
 
350 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>