More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2319 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  100 
 
 		 344 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  75.95 
 
 		 356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  69.77 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4294  transport system permease protein  70.09 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  57.73 
 
 		 346 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  65.22 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  58.6 
 
 		 345 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  63.11 
 
 		 346 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  63.75 
 
 		 346 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  48.18 
 
 		 349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  59.21 
 
 		 349 aa  285  8e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  45.65 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  44.3 
 
 		 361 aa  215  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  45 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3733  transport system permease protein  51.53 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  43.81 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  45.9 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  40.2 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  47.18 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  42.64 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  38.87 
 
 		 365 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26530  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.67 
 
 		 345 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  43.71 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  43.66 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  46.85 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  43.57 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  40.86 
 
 		 346 aa  182  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  39.6 
 
 		 355 aa  182  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  36.09 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  35.8 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  36.09 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  36.09 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  36.09 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  43.47 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3933  transport system permease protein  48.96 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  44.33 
 
 		 394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  39.94 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  39.13 
 
 		 339 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  36.09 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  47.31 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  35.5 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  32.49 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  41.9 
 
 		 663 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  39.02 
 
 		 355 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  43.88 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  32.18 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  38.73 
 
 		 344 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  41.43 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  34.31 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  38.12 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  38.66 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  37.16 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2173  transport system permease protein  45.42 
 
 		 346 aa  163  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0459545  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  37.29 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  45.07 
 
 		 350 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  41.1 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  33.33 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  44.55 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  33.33 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  46.47 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  41.81 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  39.87 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  44.9 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  33.44 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  36.96 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  36.24 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1395  iron compound ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  33.44 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.44 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  41.53 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  38.12 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  33.44 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2668  transport system permease protein  38.89 
 
 		 349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.44 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  38.81 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  36.93 
 
 		 360 aa  152  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  36.1 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  40.77 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  39.47 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  36.42 
 
 		 700 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.55 
 
 		 678 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  34.23 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  39.8 
 
 		 346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.85 
 
 		 678 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.14 
 
 		 678 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.14 
 
 		 678 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  37.18 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.14 
 
 		 678 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.14 
 
 		 678 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>